RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000250495.9

NEDD8-201, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEDD8, Length 708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-201ENST00000250495 TTC26A0AVF1 554 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 FAM13AO94988 1023 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 CYP3A5P20815 502 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 ING5Q8WYH8 240 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 KIF12Q96FN5 646 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.94■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF197O14709 1029 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 TRAK2O60296 914 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 KRT18P05783 430 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 DCNP07585 359 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 LRPAP1P30533 357 aa22.93■■□□□ 1.26
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NEDD8-201ENST00000250495 PRKCQQ04759 706 aa22.93■■□□□ 1.26
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NEDD8-201ENST00000250495 ZBTB6Q15916 424 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 SLC44A4Q53GD3 710 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 SPECC1Q5M775 1068 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 ELMOD1Q8N336 334 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 KXD1Q9BQD3 176 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 CORO1BQ9BR76 489 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.93■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 INSL5Q9Y5Q6 135 aa22.93■■□□□ 1.26
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NEDD8-201ENST00000250495 K7ENM7 598 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 OGTO15294 1046 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 ECI2O75521 394 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 MICAL2O94851 1124 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 SEC24AO95486 1093 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 PIGRP01833 764 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF131P52739 623 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 SPAG1Q07617 926 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 ADCY1Q08828 1119 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 MCM6Q14566 821 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 SLC5A9Q2M3M2 681 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 IQCEQ6IPM2 695 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 PJA1Q8NG27 643 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 RAD54LQ92698 747 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa22.92■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 KANSL1LA0AUZ9 987 aa22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 LACTBL1A8MY62 500 aa22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 M0QZQ0 153 aa22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 PLCG1P19174 1290 aa22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 TNFSF9P41273 254 aa22.91■■□□□ 1.26
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NEDD8-201ENST00000250495 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 CYP4A22Q5TCH4 519 aa22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 CD302Q8IX05 232 aa22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 FOXQ1Q9C009 403 aa22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 SEMA4AQ9H3S1 761 aa22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.91■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 FAM186AA6NE01 2351 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 OAZ2O95190 189 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 CPB1P15086 417 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 DDIT3P35638 169 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 PRSS36Q5K4E3 855 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 USP37Q86T82 979 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 C1orf210Q8IVY1 113 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 LRRC15Q8TF66 581 aa22.9■■□□□ 1.26
NEDD8-201ENST00000250495 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
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NEDD8-201ENST00000250495 A0A0B4J269 797 aa22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 ADRB2P07550 413 aa22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 CEBPBP17676 345 aa22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 PDCP20941 246 aa22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 PAX3P23760 479 aa22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP22.89■■□□□ 1.25
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NEDD8-201ENST00000250495 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.89■■□□□ 1.25
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NEDD8-201ENST00000250495 ELSPBP1Q96BH3 223 aa22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 OSBPL6Q9BZF3 934 aa22.89■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 FAM189A1O60320 539 aa22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 TWF1Q12792 350 aa22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 CUL4AQ13619 759 aa22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 TANGO2Q6ICL3 276 aa22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 BEST2Q8NFU1 509 aa22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 FAM212AQ96EL1 285 aa22.88■■□□□ 1.25
NEDD8-201ENST00000250495 NELL2Q99435 816 aa22.88■■□□□ 1.25
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