RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Def8Q99J78 448 aa10.51□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnf225Q9D7D1 332 aa10.51□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc15a2Q9ES07 729 aa10.51□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnf25Q9QZR0 456 aa10.51□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnf103Q9R1W3 683 aa10.51□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mroh5E9PUJ8 762 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 4933406M09RikG3XA12 479 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r68L7N2B3 851 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pid1Q3UBG2 217 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Agap2Q3UHD9 1186 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zbtb7bQ64321 544 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arfip2Q8K221 341 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ttc1Q91Z38 292 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tekt2Q922G7 430 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pls3Q99K51 630 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc25a19Q9DAM5 318 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm5926E9PWJ8 236 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc27a2O35488 620 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ptp4a2O70274 167 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dync1i2O88487 612 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Akap10O88845 662 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pik3caP42337 1068 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdc25cP48967 447 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 AcadsQ07417 412 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Glra4Q61603 456 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Eif4bQ8BGD9 611 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HlfQ8BW74 295 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prkag2Q91WG5 566 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tm9sf1Q9DBU0 606 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PyglQ9ET01 850 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Klrc1Q9Z202 244 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 XdhQ00519 1335 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Znf804aA2AKY4 1200 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ptpn20O55082 426 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adam15O88839 864 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Calb1P12658 261 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Myl2P51667 166 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q3U4G0 281 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Haus6Q6NV99 933 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ssxb5Q6XAS2 159 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pgm2l1Q8CAA7 621 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Bcas3Q8CCN5 928 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tph2Q8CGV2 488 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kiaa1024Q8K3V7 917 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc14a2Q8R4T9 930 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1502Q8VG66 316 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spdl1Q923A2 608 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lrp8Q924X6 996 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Usp26Q99MX1 835 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sun1Q9D666 913 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adam22Q9R1V6 904 aa10.5□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 EvplQ9D952 2035 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam205a1D3YZF6 1314 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm5795E9PZN8 263 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 DldO08749 509 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PtgisO35074 501 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Anxa8O35640 327 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 HdcP23738 662 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 NfiaQ02780 532 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyp2e1Q05421 493 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Grm2Q14BI2 872 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam178bQ24JP3 464 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Scarf1Q5ND28 820 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dlg4Q62108 724 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Klhl23Q6GQU2 558 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arhgap20Q6IFT4 1182 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PigsQ6PD26 555 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dupd1Q8BK84 215 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dus1lQ8C2P3 475 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Kat5Q8CHK4 513 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GatbQ99JT1 557 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Drc3Q9D5E4 523 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Iqcf1Q9D9K8 182 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Angptl2Q9R045 493 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Btbd19S4R1I0 287 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccdc175E9PVB3 822 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Krt19P19001 403 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Klf1P46099 358 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 LipeP54310 759 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ppp3caP63328 521 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam172aQ3TNH5 417 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Nat8lQ3UGX3 299 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Odr4Q4PJX1 447 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trim65Q8BFW4 522 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dnali1Q8BVN8 258 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sde2Q8K1J5 448 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Actr3Q99JY9 418 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cnot8Q9D8X5 292 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ap2b1Q9DBG3 937 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Noa1Q9JJG9 693 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ggt5Q9Z2A9 573 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm3095E9Q058 166 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10250G3X9L6 160 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Dnase1l3O55070 310 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 GalcP54818 684 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 RalaP63321 206 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Meis2P97367 477 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fgfr4Q03142 799 aa10.49□□□□□ -0.73
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Atp13a5Q3TYU2 1216 aa10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.1 ms