Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Arfip2Q8K221 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Arfip2Q8K221 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Arfip2Q8K221 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Arfip2Q8K221 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Arfip2Q8K221 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Arfip2Q8K221 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Arfip2Q8K221 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Arfip2Q8K221 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Arfip2Q8K221 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Arfip2Q8K221 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Arfip2Q8K221 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Arfip2Q8K221 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Arfip2Q8K221 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Arfip2Q8K221 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Arfip2Q8K221 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Arfip2Q8K221 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
Arfip2Q8K221 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Arfip2Q8K221 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Arfip2Q8K221 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Arfip2Q8K221 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Arfip2Q8K221 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Arfip2Q8K221 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Arfip2Q8K221 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Arfip2Q8K221 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Arfip2Q8K221 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Arfip2Q8K221 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
Arfip2Q8K221 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Arfip2Q8K221 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Arfip2Q8K221 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Arfip2Q8K221 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Arfip2Q8K221 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Arfip2Q8K221 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Arfip2Q8K221 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Arfip2Q8K221 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Arfip2Q8K221 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Arfip2Q8K221 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Arfip2Q8K221 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Arfip2Q8K221 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Arfip2Q8K221 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Arfip2Q8K221 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Arfip2Q8K221 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Arfip2Q8K221 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Arfip2Q8K221 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Arfip2Q8K221 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Arfip2Q8K221 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Arfip2Q8K221 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Arfip2Q8K221 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Arfip2Q8K221 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Arfip2Q8K221 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Arfip2Q8K221 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Arfip2Q8K221 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Arfip2Q8K221 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Arfip2Q8K221 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Arfip2Q8K221 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Arfip2Q8K221 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Arfip2Q8K221 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Arfip2Q8K221 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Arfip2Q8K221 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Arfip2Q8K221 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Arfip2Q8K221 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Arfip2Q8K221 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Arfip2Q8K221 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Arfip2Q8K221 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Arfip2Q8K221 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Arfip2Q8K221 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Arfip2Q8K221 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Arfip2Q8K221 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Arfip2Q8K221 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Arfip2Q8K221 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Arfip2Q8K221 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Arfip2Q8K221 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Arfip2Q8K221 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Arfip2Q8K221 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Arfip2Q8K221 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Arfip2Q8K221 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Arfip2Q8K221 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Arfip2Q8K221 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Arfip2Q8K221 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arfip2Q8K221 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arfip2Q8K221 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Arfip2Q8K221 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arfip2Q8K221 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Arfip2Q8K221 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Arfip2Q8K221 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Arfip2Q8K221 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Arfip2Q8K221 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Arfip2Q8K221 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Arfip2Q8K221 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Arfip2Q8K221 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Arfip2Q8K221 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Arfip2Q8K221 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Arfip2Q8K221 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Arfip2Q8K221 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Arfip2Q8K221 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Arfip2Q8K221 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Arfip2Q8K221 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Arfip2Q8K221 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Arfip2Q8K221 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Arfip2Q8K221 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms