Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.2■■■■■ 4.19
Pls3Q99K51 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Pls3Q99K51 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Pls3Q99K51 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Pls3Q99K51 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Pls3Q99K51 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
Pls3Q99K51 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Pls3Q99K51 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Pls3Q99K51 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Pls3Q99K51 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Pls3Q99K51 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Pls3Q99K51 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Pls3Q99K51 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Pls3Q99K51 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Pls3Q99K51 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Pls3Q99K51 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Pls3Q99K51 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Pls3Q99K51 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Pls3Q99K51 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Pls3Q99K51 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Pls3Q99K51 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Pls3Q99K51 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Pls3Q99K51 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Pls3Q99K51 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Pls3Q99K51 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Pls3Q99K51 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Pls3Q99K51 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Pls3Q99K51 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Pls3Q99K51 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Pls3Q99K51 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Pls3Q99K51 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Pls3Q99K51 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Pls3Q99K51 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Pls3Q99K51 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Pls3Q99K51 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
Pls3Q99K51 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pls3Q99K51 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Pls3Q99K51 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Pls3Q99K51 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pls3Q99K51 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Pls3Q99K51 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Pls3Q99K51 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Pls3Q99K51 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Pls3Q99K51 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Pls3Q99K51 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Pls3Q99K51 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Pls3Q99K51 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Pls3Q99K51 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Pls3Q99K51 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Pls3Q99K51 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pls3Q99K51 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pls3Q99K51 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Pls3Q99K51 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Pls3Q99K51 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Pls3Q99K51 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
Pls3Q99K51 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Pls3Q99K51 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Pls3Q99K51 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Pls3Q99K51 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Pls3Q99K51 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Pls3Q99K51 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Pls3Q99K51 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Pls3Q99K51 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Pls3Q99K51 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Pls3Q99K51 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Pls3Q99K51 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Pls3Q99K51 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Pls3Q99K51 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Pls3Q99K51 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
Pls3Q99K51 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Pls3Q99K51 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Pls3Q99K51 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Pls3Q99K51 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Pls3Q99K51 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Pls3Q99K51 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Pls3Q99K51 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Pls3Q99K51 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Pls3Q99K51 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Pls3Q99K51 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Pls3Q99K51 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Pls3Q99K51 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Pls3Q99K51 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Pls3Q99K51 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Pls3Q99K51 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Pls3Q99K51 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Pls3Q99K51 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Pls3Q99K51 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Pls3Q99K51 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pls3Q99K51 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Pls3Q99K51 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pls3Q99K51 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pls3Q99K51 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pls3Q99K51 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pls3Q99K51 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Pls3Q99K51 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Pls3Q99K51 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Pls3Q99K51 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Pls3Q99K51 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Pls3Q99K51 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Pls3Q99K51 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 256 ms