Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9K8

Iqcf1, IQ domain-containing protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iqcf1Q9D9K8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC36,05■■■■□ 3,36
Iqcf1Q9D9K8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
Iqcf1Q9D9K8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,35■■■■□ 3,09
Iqcf1Q9D9K8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,27■■■■□ 3,08
Iqcf1Q9D9K8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,19■■■□□ 2,9
Iqcf1Q9D9K8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Iqcf1Q9D9K8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,73■■■□□ 2,83
Iqcf1Q9D9K8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
Iqcf1Q9D9K8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,45■■■□□ 2,79
Iqcf1Q9D9K8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,34■■■□□ 2,77
Iqcf1Q9D9K8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC32,31■■■□□ 2,76
Iqcf1Q9D9K8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
Iqcf1Q9D9K8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,99■■■□□ 2,71
Iqcf1Q9D9K8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC31,82■■■□□ 2,68
Iqcf1Q9D9K8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Iqcf1Q9D9K8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,76■■■□□ 2,67
Iqcf1Q9D9K8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC31,74■■■□□ 2,67
Iqcf1Q9D9K8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,73■■■□□ 2,67
Iqcf1Q9D9K8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,35■■■□□ 2,61
Iqcf1Q9D9K8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,21■■■□□ 2,59
Iqcf1Q9D9K8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,05■■■□□ 2,56
Iqcf1Q9D9K8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Iqcf1Q9D9K8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Iqcf1Q9D9K8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Iqcf1Q9D9K8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,96■■■□□ 2,55
Iqcf1Q9D9K8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Iqcf1Q9D9K8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Iqcf1Q9D9K8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC30,87■■■□□ 2,53
Iqcf1Q9D9K8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC30,85■■■□□ 2,53
Iqcf1Q9D9K8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,83■■■□□ 2,53
Iqcf1Q9D9K8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,75■■■□□ 2,51
Iqcf1Q9D9K8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Iqcf1Q9D9K8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC30,66■■■□□ 2,5
Iqcf1Q9D9K8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Iqcf1Q9D9K8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,51■■■□□ 2,48
Iqcf1Q9D9K8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,48■■■□□ 2,47
Iqcf1Q9D9K8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Iqcf1Q9D9K8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,37■■■□□ 2,45
Iqcf1Q9D9K8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,35■■■□□ 2,45
Iqcf1Q9D9K8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC30,2■■■□□ 2,43
Iqcf1Q9D9K8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30,14■■■□□ 2,42
Iqcf1Q9D9K8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30,09■■■□□ 2,41
Iqcf1Q9D9K8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Iqcf1Q9D9K8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Iqcf1Q9D9K8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Iqcf1Q9D9K8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,01■■■□□ 2,39
Iqcf1Q9D9K8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,38
Iqcf1Q9D9K8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Iqcf1Q9D9K8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Iqcf1Q9D9K8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Iqcf1Q9D9K8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC29,72■■■□□ 2,35
Iqcf1Q9D9K8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Iqcf1Q9D9K8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29,64■■■□□ 2,33
Iqcf1Q9D9K8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Iqcf1Q9D9K8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Iqcf1Q9D9K8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Iqcf1Q9D9K8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Iqcf1Q9D9K8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Iqcf1Q9D9K8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Iqcf1Q9D9K8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29,37■■■□□ 2,29
Iqcf1Q9D9K8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Iqcf1Q9D9K8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Iqcf1Q9D9K8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Iqcf1Q9D9K8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,26■■■□□ 2,27
Iqcf1Q9D9K8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,25■■■□□ 2,27
Iqcf1Q9D9K8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,2■■■□□ 2,27
Iqcf1Q9D9K8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,19■■■□□ 2,26
Iqcf1Q9D9K8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Iqcf1Q9D9K8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Iqcf1Q9D9K8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2,23
Iqcf1Q9D9K8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Iqcf1Q9D9K8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Iqcf1Q9D9K8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Iqcf1Q9D9K8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Iqcf1Q9D9K8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
Iqcf1Q9D9K8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
Iqcf1Q9D9K8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Iqcf1Q9D9K8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,7■■■□□ 2,18
Iqcf1Q9D9K8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
Iqcf1Q9D9K8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Iqcf1Q9D9K8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Iqcf1Q9D9K8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Iqcf1Q9D9K8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Iqcf1Q9D9K8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Iqcf1Q9D9K8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC28,5■■■□□ 2,15
Iqcf1Q9D9K8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,47■■■□□ 2,15
Iqcf1Q9D9K8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC28,46■■■□□ 2,15
Iqcf1Q9D9K8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Iqcf1Q9D9K8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Iqcf1Q9D9K8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Iqcf1Q9D9K8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Iqcf1Q9D9K8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,41■■■□□ 2,14
Iqcf1Q9D9K8 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Iqcf1Q9D9K8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Iqcf1Q9D9K8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Iqcf1Q9D9K8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Iqcf1Q9D9K8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Iqcf1Q9D9K8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Iqcf1Q9D9K8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,24■■■□□ 2,11
Iqcf1Q9D9K8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33,7 ms