RNA–Protein interactions for RNA: YPR178W

PRP4, Transcript of Splicing factor, yeastyeast

Gene PRP4, Length 1,398 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP4YPR178W GWT1P47026 490 aa9.1□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W SLX9P53251 210 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W YOR352WQ08816 343 aa9.1□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W ATX2Q12067 313 aa9.1□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W TMA17Q12513 150 aa9.1□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W HAA1Q12753 694 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W LSB5P25369 354 aa9.09□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W EHD3P28817 500 aa9.09□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W YBR197CP38306 217 aa9.09□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W MGE1P38523 228 aa9.09□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W SMD3P43321 101 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W YAP1802P53309 568 aa9.09□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W ALG12P53730 551 aa9.09□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W HCH1P53834 153 aa9.09□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W RHO5P53879 331 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W CUZ1P53899 274 aa9.09□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W GIC2Q06648 383 aa9.09□□□□□ -0.95
PRP4YPR178W CET1O13297 549 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W SCEIP03882 235 aa9.08□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W SEC62P21825 274 aa9.08□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W AIM17P23180 465 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W SPT23P35210 1082 aa9.08□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W AIM3P38266 947 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W FLO5P38894 1075 aa9.08□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W NOP16P40007 231 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W RTS2P40962 232 aa9.08□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W YFR054CP43622 192 aa9.08□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W ERG25P53045 309 aa9.08□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W SMM1P53720 384 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W FSH2Q05015 223 aa9.08□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W TMA10Q06177 86 aa9.08□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W MCH4Q08268 501 aa9.08□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W AGC1Q12482 902 aa9.08□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W YNR034W-AQ3E841 98 aa9.08□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W RPL25P04456 142 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W AFG1P32317 509 aa9.07□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W YJL193WP39542 402 aa9.07□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W AGE1Q04412 482 aa9.07□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W IRC19Q07843 230 aa9.07□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W TDH3P00359 332 aaKnown RBP RIP-Chip data9.06□□□□□ -0.96not detected
PRP4YPR178W DAT1P13483 248 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W MRS4P23500 304 aa9.06□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W STP22P25604 385 aa9.06□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W PTC7P38797 343 aa9.06□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W HSP10P38910 106 aa9.06□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W PEX7P39108 375 aa9.06□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W PAU5P43575 122 aa9.06□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W YJR012CP47087 207 aa9.06□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W SEH1P53011 349 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W PAU4P53427 120 aa9.06□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W YDR444WQ04093 687 aa9.06□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W YDL242WQ07746 117 aa9.06□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W FCY22Q12119 530 aa9.06□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W ERG27Q12452 347 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W RAX2Q12465 1220 aa9.06□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W RIP1P08067 215 aa9.05□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W NHP6AP11632 93 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W CKA1P15790 372 aa9.05□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W MRPL15P36523 253 aa9.05□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W IRC22P40006 225 aa9.05□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W HSV2P50079 448 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W YLR460CP54007 376 aa9.05□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W PAL1Q05518 499 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W PIB1Q06651 286 aa9.05□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W FYV7Q12247 151 aa9.05□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W SME1Q12330 94 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W COA2Q3E823 68 aa9.05□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W YIL134C-AQ45U18 67 aa9.05□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W YDR157WA0A023PZE8 133 aa9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W YSF3P0C074 85 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W PAU1P0CE88 120 aa9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W PAU14P0CE89 120 aa9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W PAU6P0CE90 120 aa9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W PAU18P0CE91 120 aa9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W PAU8P0CE92 120 aa9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W PAU11P0CE93 120 aa9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W RML2P32611 393 aa9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W RPL14AP36105 138 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W FIG1P38224 298 aa9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W YBR096WP38256 230 aa9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W PAU13P38725 120 aa9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W RPL14BP38754 138 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W POP2P39008 433 aa9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W PIG2P40187 538 aa9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W RPA34P47006 233 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W PAU10Q03050 120 aa9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W YMR090WQ04304 227 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W YPR147CQ06522 304 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W PAU20Q08322 120 aa9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W YOP1Q12402 180 aa9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W PAU9Q3E770 120 aa9.04□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W YMR084WA2P2R3 262 aa9.03□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W CDC28P00546 298 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W RPS14AP06367 137 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W MKK2P32491 506 aa9.03□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W GLC7P32598 312 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W RPS14BP39516 138 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
PRP4YPR178W ELO1P39540 310 aa9.03□□□□□ -0.96
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