RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeastyeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11YML043C YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C MBF1O14467 151 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C HIS1P00498 297 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C VAR1P02381 398 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C RPS28BP0C0X0 67 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C YML003WP0CF16 290 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C NOP1P15646 327 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C ATP10P18496 279 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C OLE1P21147 510 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C YHR210CP38893 341 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C AXL2P38928 823 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C YAL037WP39728 267 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C ISC1P40015 477 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C ERG28P40030 148 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C JHD1P40034 492 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C YNL195CP40168 261 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C HIT1P46973 164 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C SFH5P47008 294 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C YHC3P47040 408 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C YJR015WP47090 510 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C RRT6P53117 311 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C MTL1P53214 551 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C SAY1P53324 424 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C DAD3P69850 94 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C RPS15Q01855 142 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C TMA23Q03525 211 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C RCE1Q03530 315 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C HPT1Q04178 221 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C SWC7Q06707 132 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C AAD4Q07747 329 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C YCT1Q12235 531 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C YLR118CQ12354 227 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C GEP5Q12393 293 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C RPS28AQ3E7X9 67 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C MHF2Q3E829 80 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C DET1Q99288 334 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C BI3Q9ZZW7 517 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C BNI1P41832 1953 aa3.83□□□□□ -1.8
RRN11YML043C RAS2P01120 322 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C RPS13P05756 151 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C CDC33P07260 213 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C YBR121C-AP0C5L4 52 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C TY2A-FP0CX61 438 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C TY2A-GR2P0CX62 438 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data3.82□□□□□ -1.8not detected
RRN11YML043C ANB1P19211 157 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C IDH2P28241 369 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C SYN8P31377 255 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C MTC7P32633 139 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C EMP70P32802 667 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C YOR062CP36025 268 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C YKL071WP36086 256 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C CBP4P37267 147 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C DOG1P38774 246 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C YPT35P38815 214 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C YHR130CP38834 111 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C PAC2P39937 518 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C ARG2P40360 574 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C AVT7P40501 490 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C FIS1P40515 155 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C EMC5P40540 141 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C POP1P41812 875 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C SMD3P43321 101 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C ERJ5P43613 295 aaPredicted RBP3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C RPA43P46669 326 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C BIT61P47041 543 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C MUP1P50276 574 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C MGA1P53050 456 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C LST7P53237 242 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C FRE4P53746 719 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C TIM8P57744 87 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C APS2Q00381 147 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C TPS1Q00764 495 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C ATG21Q02887 496 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C GAS3Q03655 524 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C ROT1Q03691 256 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C MSS11Q03825 758 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C CTR3Q06686 241 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C POS5Q06892 414 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C MCH1Q07376 486 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C CRD1Q07560 283 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C THP1Q08231 455 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C GPB1Q08886 897 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C FCY22Q12119 530 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C UBX3Q12229 455 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C WTM1Q12363 437 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C YMR030W-AQ3E760 96 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C ISD11Q6Q560 94 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C RIM15P43565 1770 aa3.82□□□□□ -1.8
RRN11YML043C PUT1P09368 476 aa3.81□□□□□ -1.8
RRN11YML043C PAU19P0CE85 124 aa3.81□□□□□ -1.8
RRN11YML043C PAU21P0CE86 164 aa3.81□□□□□ -1.8
RRN11YML043C PAU22P0CE87 164 aa3.81□□□□□ -1.8
RRN11YML043C PAU3P25610 124 aa3.81□□□□□ -1.8
RRN11YML043C DCG1P32460 244 aa3.81□□□□□ -1.8
RRN11YML043C GCS1P35197 352 aa3.81□□□□□ -1.8
RRN11YML043C YKL070WP36087 169 aa3.81□□□□□ -1.8
RRN11YML043C GEX2P36173 615 aa3.81□□□□□ -1.8
RRN11YML043C REG2P38232 338 aa3.81□□□□□ -1.8
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