RNA–Protein interactions for RNA: YFR032C

RRT5, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene RRT5, Length 870 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT5YFR032C ATO3Q12359 275 aa8.56□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C GCN4P03069 281 aa8.55□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C RPS31P05759 152 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C GAR1P28007 205 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C SMB1P40018 196 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C AVT6P40074 448 aa8.55□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C CTF19Q02732 369 aa8.55□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C YEL009C-AA0A023PZF2 135 aa8.54□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C FUR4P05316 633 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C ERG2P32352 222 aa8.54□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C RPA43P46669 326 aa8.54□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C GWT1P47026 490 aa8.54□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C YAE1P47118 141 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C DOC1P53068 250 aa8.54□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C FIT1Q04433 528 aa8.54□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C RBD2Q12270 262 aa8.54□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C YLR122CQ12312 125 aa8.54□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C MET17P06106 444 aa8.53□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C YCR061WP25639 631 aa8.53□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C RAD23P32628 398 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data8.53□□□□□ -1.04not detected
RRT5YFR032C SWD3P38123 315 aa8.53□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C YBR137WP38276 179 aa8.53□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C SYS1P41544 203 aa8.53□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C FIP1P45976 327 aa8.53□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C MRPL13Q02204 264 aa8.53□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C HNT1Q04344 158 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RRT5YFR032C ERG3P32353 365 aa8.52□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C VAM7P32912 316 aa8.52□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C GPI14P47088 403 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C BXI1P48558 297 aa8.52□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C YGR151CP53287 111 aa8.52□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C HOF1Q05080 669 aa8.52□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C MDM36Q06820 579 aa8.52□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C DGK1Q12382 290 aa8.52□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C DPB2P24482 689 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C INO2P26798 304 aa8.51□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C MTC7P32633 139 aa8.51□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C YKL075CP36083 450 aa8.51□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C PRS4P38063 326 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C RTT105P40063 208 aa8.51□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C BNA6P43619 295 aa8.51□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C YJL118WP47022 219 aa8.51□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C YNL234WP53857 426 aa8.51□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C MAK3Q03503 176 aa8.51□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C YPD1Q07688 167 aa8.51□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C RNA14P25298 677 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C PDS1P40316 373 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C PRM5P40476 318 aa8.5□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C GPN3Q06543 272 aa8.5□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C TFC7Q12415 435 aa8.5□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C YOR192C-CQ3E736 78 aa8.5□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C VMA5P31412 392 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C OCH1P31755 480 aa8.49□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C SOL1P50278 321 aa8.49□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C GRX3Q03835 250 aa8.49□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C HOR7Q05827 59 aa8.49□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C JID1Q12350 301 aa8.49□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C CDC34P14682 295 aa8.48□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C BMT5P40493 336 aa8.48□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C IMO32P53219 342 aa8.48□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C YMR130WQ04223 302 aa8.48□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C YDL086WQ07505 273 aa8.48□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C HIS3P06633 220 aa8.47□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C PET54P10834 293 aa8.47□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C FUS3P16892 353 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C BUD23P25627 275 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C UTP30P36144 274 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C YJL213WP40896 331 aa8.47□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C VPS55P47111 140 aa8.47□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C FMP48P53233 369 aa8.47□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C BUD25P85052 153 aa8.47□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C LAS17Q12446 633 aa8.47□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C ODC2Q99297 307 aa8.47□□□□□ -1.05
RRT5YFR032C YLL053CP0CD98 152 aa8.46□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C YHR212W-AP0CX91 67 aa8.46□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C OLE1P21147 510 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C RFA1P22336 621 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C IFM1P25038 676 aa8.46□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C LSB5P25369 354 aa8.46□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C SPS18P32572 300 aa8.46□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C GOS1P38736 223 aa8.46□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C RCF1Q03713 159 aa8.46□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C DPB4Q04603 196 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C PUP1P25043 261 aa8.45□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C YBR144CP34215 104 aa8.45□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C SRY1P36007 326 aa8.45□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C YHK8P38776 514 aa8.45□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C RPL9BP51401 191 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C SLX9P53251 210 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C TDA1Q03533 586 aa8.45□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C LPP1Q04396 274 aa8.45□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C YOS1Q3E834 85 aa8.45□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C CHO1P08456 276 aa8.44□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C URA6P15700 204 aa8.44□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C MRP20P32387 263 aa8.44□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C REC104P33323 182 aa8.44□□□□□ -1.06
RRT5YFR032C YUH1P35127 236 aa8.44□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.9 ms