RNA–Protein interactions for RNA: YBR228W

SLX1, Transcript of Endonuclease involved in DNA recombination and repair, yeast

Gene SLX1, Length 915 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX1	YBR228W	YMR252C	Q04814	134 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	MRX8	Q05473	314 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	GAS2	Q06135	555 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	YPR1	Q12458	312 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SLX1	YBR228W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	MSW1	P04803	379 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	CKA1	P15790	372 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	SPO7	P18410	259 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	DBF2	P22204	572 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	DOA4	P32571	926 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	NPL6	P32832	435 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	SEC66	P33754	206 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	MRPL39	P36533	70 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	MIX23	P38162	196 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	PEX32	P38292	413 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	CCC1	P47818	322 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	PCP1	P53259	346 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	HAL1	Q01766	294 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	AIM36	Q03798	255 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	YDL180W	Q12301	547 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	COX9	P07255	59 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	PAU2	P32612	120 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	ZRT3	P34240	503 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	YBR137W	P38276	179 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	YMR262W	P38430	313 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	ATG18	P43601	500 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	PMT5	P52867	743 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	MRPL19	P53875	158 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	MRP51	Q02950	344 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	GPI17	Q04080	534 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	NNT1	Q05874	261 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	GPN3	Q06543	272 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	PEX27	Q08580	376 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	MED2	Q12124	431 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	MSH5	Q12175	901 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	QCR7	P00128	127 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	SCEI	P03882	235 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	ITR1	P30605	584 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	SPT10	P35208	640 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	TMA19	P35691	167 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	CMC1	P36064	111 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.5	□□□□□ -1.85	not detected
SLX1	YBR228W	YHK8	P38776	514 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	GPI16	P38875	610 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	TIR3	P40552	269 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	DOC1	P53068	250 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	YGL204C	P53089	101 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	MRH4	P53166	561 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	CIK1	Q01649	594 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	TDA1	Q03533	586 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	ASR1	Q06834	288 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	RAF1	Q06891	181 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	RTN2	Q12443	393 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	BPH1	P25356	2167 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	HIS3	P06633	220 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	PRB1	P09232	635 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	ATG15	P25641	520 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	ZUO1	P32527	433 aa	Known RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	SFK1	P35735	353 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	FRM2	P37261	193 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	RIB5	P38145	238 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	MBA1	P38300	278 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	FCY21	P40039	528 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	RTT105	P40063	208 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	SER2	P42941	309 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	MTM1	P53320	366 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	MEH1	Q02205	184 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	YDR387C	Q04162	555 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	ATG41	Q12048	136 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	MCT1	Q12283	360 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	SCM3	Q12334	223 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	TRA1	P38811	3744 aa		3.49	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	COX5B	P00425	151 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	HEM4	P06174	275 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SLX1	YBR228W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		3.48	□□□□□ -1.85

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