RNA–Protein interactions for RNA: YBL037W

APL3, Transcript of Alpha-adaptin, yeast

Gene APL3, Length 3,078 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APL3	YBL037W	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	SIP3	P38717	1229 aa		0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	HOC1	P47124	396 aa		0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	RMR1	P53060	241 aa		0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	CTF19	Q02732	369 aa		0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	CDC123	Q05791	360 aa		0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	DCR2	Q05924	578 aa		0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	YPL257W	Q08974	193 aa		0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	YPR011C	Q12251	326 aa		0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	JLP1	Q12358	412 aa		0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	BBP1	Q12365	385 aa		0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	GIS3	Q12418	502 aa		0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	PRM7	Q12459	698 aa		0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	NCB2	Q92317	146 aa		0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	YAR068W	P39564	161 aa		0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	MRH4	P53166	561 aa		0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	YPL039W	Q03080	316 aa		0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	TIM22	Q12328	207 aa		0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	ATG5	Q12380	294 aa		0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	COX5A	P00424	153 aa		0.9	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	COS2	P0CX12	379 aa		0.9	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	COS3	P0CX13	379 aa		0.9	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	PPH21	P23594	369 aa		0.9	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	YKR032W	P36127	104 aa		0.9	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	GOS1	P38736	223 aa		0.9	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	COS4	P43542	379 aa		0.9	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	YFR045W	P43617	309 aa		0.9	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	GLG2	P47011	380 aa		0.9	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	SYF2	P53277	215 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	YPL229W	Q99395	206 aa		0.9	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	HTL1	Q9URQ5	78 aa		0.9	□□□□□ -2.26
APL3	YBL037W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	RIB1	P38066	345 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	COS8	P38723	381 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	TRM5	P38793	499 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YER189W	P40104	122 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	FIS1	P40515	155 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	RPC17	P47076	161 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	TRM9	P49957	279 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	MIC26	P50087	233 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YMR166C	Q03829	368 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YDR222W	Q04925	415 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YOR020W-A	Q3E824	90 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	SWI1	P09547	1314 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	CBF1	P17106	351 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	SEC22	P22214	214 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YCR102C	P25608	368 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	VMA11	P32842	164 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YPT52	P36018	234 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	RCN1	P36054	211 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	SKG1	P36169	355 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YNL194C	P40169	301 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	RAD17	P48581	401 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YML096W	Q04489	525 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	COQ10	Q08058	207 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	GET4	Q12125	312 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	MDM32	Q12171	622 aa		0.9	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	RAD10	P06838	210 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	MET2	P08465	486 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	URA6	P15700	204 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YJL016W	P47072	561 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	MCM22	P47167	239 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	NUP57	P48837	541 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	SEI1	Q06058	285 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	DCN1	Q12395	269 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	SAS5	Q99314	248 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	LYS2	P07702	1392 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YLR462W	O13556	202 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	HTB1	P02293	131 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	HTB2	P02294	131 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	FCY2	P17064	533 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YEL075C	P39972	122 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	RMD6	P39975	231 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	ERG28	P40030	148 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	BXI1	P48558	297 aa		0.89	□□□□□ -2.27

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