RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 SFXN1Q9H9B4 322 aa24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 STYXL1Q9Y6J8 313 aa24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 C5orf42Q9H799 3197 aa24.34■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 LACTBL1A8MY62 500 aa24.33■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 TISP43B9A030 160 aa24.33■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 FAM189A1O60320 539 aa24.33■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 ACOT2P49753 483 aa24.33■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 KCNA1Q09470 495 aa24.33■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 PSMD5Q16401 504 aa24.33■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 ATAT1Q5SQI0 421 aa24.33■■□□□ 1.49
SYT6-210ENST00000641643 MAN1C1Q9NR34 630 aa24.33■■□□□ 1.49
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SYT6-210ENST00000641643 C19orf67A6NJJ6 358 aa24.33■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 RPL17P18621 184 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.48
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SYT6-210ENST00000641643 AFMP43652 599 aa24.33■■□□□ 1.48
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SYT6-210ENST00000641643 CASP5P51878 434 aa24.33■■□□□ 1.48
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SYT6-210ENST00000641643 C3orf58Q8NDZ4 430 aa24.33■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
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SYT6-210ENST00000641643 CYP3A5P20815 502 aa24.32■■□□□ 1.48
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SYT6-210ENST00000641643 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
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SYT6-210ENST00000641643 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa24.32■■□□□ 1.48
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SYT6-210ENST00000641643 C1RP00736 705 aa24.31■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 ADSSP30520 456 aa24.31■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 CD300LGQ6UXG3 332 aa24.31■■□□□ 1.48
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SYT6-210ENST00000641643 I3L4J1 428 aa24.3■■□□□ 1.48
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SYT6-210ENST00000641643 FAM26FQ5R3K3 315 aa24.3■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 KANK3Q6NY19 840 aa24.3■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 ANKS3Q6ZW76 656 aa24.3■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 BEST2Q8NFU1 509 aa24.3■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 HDAC7Q8WUI4 952 aa24.3■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 HPS3Q969F9 1004 aa24.3■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa24.3■■□□□ 1.48
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SYT6-210ENST00000641643 SERTAD1Q9UHV2 236 aa24.3■■□□□ 1.48
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SYT6-210ENST00000641643 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa24.29■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 CLSTN3Q9BQT9 956 aa24.29■■□□□ 1.48
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SYT6-210ENST00000641643 CDH22Q9UJ99 828 aa24.29■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 SYN3O14994 580 aa24.29■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 GARTP22102 1010 aa24.29■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 LRPAP1P30533 357 aa24.29■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 JADE1Q6IE81 842 aa24.29■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 NR2E1Q9Y466 385 aa24.29■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP24.28■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 CASP1P29466 404 aa24.28■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 SYKP43405 635 aa24.28■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 CUL4BQ13620 913 aa24.28■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 TMEM132DQ14C87 1099 aa24.28■■□□□ 1.48
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SYT6-210ENST00000641643 GPR149Q86SP6 731 aa24.28■■□□□ 1.48
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SYT6-210ENST00000641643 POMKQ9H5K3 350 aa24.28■■□□□ 1.48
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SYT6-210ENST00000641643 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa24.27■■□□□ 1.48
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SYT6-210ENST00000641643 OR1D2P34982 312 aa24.27■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 SPATA1Q5VX52 437 aa24.27■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 ARMCX5Q6P1M9 558 aa24.27■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 GLIS3Q8NEA6 775 aa24.27■■□□□ 1.48
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SYT6-210ENST00000641643 SUSD3Q96L08 255 aa24.27■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 FAM213AQ9BRX8 229 aa24.27■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 GDPD2Q9HCC8 539 aa24.27■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 C2CD2Q9Y426 696 aa24.27■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 BACE2Q9Y5Z0 518 aa24.27■■□□□ 1.48
SYT6-210ENST00000641643 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa24.26■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
SYT6-210ENST00000641643 NFICP08651 508 aa24.26■■□□□ 1.47
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