RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635929.1

PLCB1-223, Transcript of phospholipase C beta 1, human

TSL 5

Gene PLCB1, Length 2,291 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLCB1-223	ENST00000635929	EURL	Q9NYK6	297 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	RGL2	O15211	777 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	MARCH6	O60337	910 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	CLPTM1	O96005	669 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	MARCKSL1	P49006	195 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	OXCT1	P55809	520 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	OVGP1	Q12889	678 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	SLC1A5	Q15758	541 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	TMCO4	Q5TGY1	634 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	KLHDC10	Q6PID8	442 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	ARMCX6	Q7L4S7	300 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	KLHL4	Q9C0H6	718 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	KIAA1586	Q9HCI6	787 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	GPAM	Q9HCL2	828 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	ARHGEF38	Q9NXL2	777 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		10.05	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	FAM170A	A1A519	330 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	WDR91	A4D1P6	747 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	MAFG	O15525	162 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	CYTH3	O43739	400 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	SPOP	O43791	374 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	PDE8A	O60658	829 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	PGM3	O95394	542 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	KCNA6	P17658	529 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	FUT4	P22083	530 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	IVD	P26440	423 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	GTF2H1	P32780	548 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	PIK3CA	P42336	1068 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	XIAP	P98170	497 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	CDK16	Q00536	496 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	GRM4	Q14833	912 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	PDK3	Q15120	406 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	SIX1	Q15475	284 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	C1orf146	Q5VVC0	180 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	AAGAB	Q6PD74	315 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	RELL1	Q8IUW5	271 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	KSR1	Q8IVT5	923 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	GAB3	Q8WWW8	586 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	PRICKLE1	Q96MT3	831 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	MXD3	Q9BW11	206 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	MTMR7	Q9Y216	660 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	BIRC5	O15392	142 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	MAGEB3	O15480	346 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	AP1G1	O43747	822 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	SMARCA1	P28370	1054 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	HOXD12	P35452	270 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	MAGEA4	P43358	317 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	TFAP4	Q01664	338 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	ECM1	Q16610	540 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	MAPK6	Q16659	721 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	TDRP	Q86YL5	185 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	SLF2	Q8IX21	1173 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	PWWP2A	Q96N64	755 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	PANX3	Q96QZ0	392 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	THEG	Q9P2T0	379 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	SUN2	Q9UH99	717 aa		10.04	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	PDXK	O00764	312 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	SORBS3	O60504	671 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	AKAP3	O75969	853 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	TM7SF2	O76062	418 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	ABHD2	P08910	425 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	CPA3	P15088	417 aa		10.03	□□□□□ -0.8
PLCB1-223	ENST00000635929	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms