RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	EGF	P01133	1207 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	FECH	P22830	423 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	DSG1	Q02413	1049 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	CREM	Q03060	361 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	FBXO43	Q4G163	708 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	FRMD1	Q8N878	549 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	OXER1	Q8TDS5	423 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	MYH4	Q9Y623	1939 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	NCAN	O14594	1321 aa		7.27	□□□□□ -1.24
SNAP23-222	ENST00000626061	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	WDR64	B1ANS9	1081 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	MPO	P05164	745 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	C1S	P09871	688 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	GABRE	P78334	506 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	LTB	Q06643	244 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	PTPA	Q15257	358 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	TBR1	Q16650	682 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	FAM228A	Q86W67	206 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	E2F7	Q96AV8	911 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	RMDN3	Q96TC7	470 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	TMUB1	Q9BVT8	246 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	FNIP2	Q9P278	1114 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	TRIM66	O15016	1216 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	KCNAB3	O43448	404 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	GJB6	O95452	261 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	MARK3	P27448	753 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	SP2	Q02086	613 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	SCRN1	Q12765	414 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	PSMD2	Q13200	908 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	INAVA	Q3KP66	663 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	KCTD1	Q719H9	257 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	NME8	Q8N427	588 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	HEATR9	A2RTY3	570 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	RRN3P2	A6NIE6	340 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	ALDH2	P05091	517 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	NR3C2	P08235	984 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	TGFB3	P10600	412 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	DRD1	P21728	446 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	ADCY7	P51828	1080 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	CLCA4	Q14CN2	919 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	MKL1	Q969V6	931 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	GMCL1	Q96IK5	515 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	ZFR	Q96KR1	1074 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	HSPA12B	Q96MM6	686 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	COL1A2	P08123	1366 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	ESPL1	Q14674	2120 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A0U1RQF3	1178 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	ENC1	O14682	589 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF197	O14709	1029 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	TTLL1	O95922	423 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SNAP23-222	ENST00000626061	LDLR	P01130	860 aa		7.24	□□□□□ -1.25

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