RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597718.5

FCHO1-222, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 884 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-222ENST00000597718 SPIRE2Q8WWL2 714 aa15.41■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa15.41■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 SLC38A7Q9NVC3 462 aa15.41■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 CNTN3Q9P232 1028 aa15.41■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 DOCK6Q96HP0 2047 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 ANHXE9PGG2 379 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 GFRA3O60609 400 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 TOM1L1O75674 476 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 SRFP11831 508 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 KCNE1P15382 129 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 HOXA9P31269 272 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 SMTNP53814 917 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 ARPP19P56211 112 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 PARM1Q6UWI2 310 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 ANKS3Q6ZW76 656 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 LRRC15Q8TF66 581 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 FGF14Q92915 247 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 WNT16Q9UBV4 365 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 CDH7Q9ULB5 785 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 BACE2Q9Y5Z0 518 aa15.4■□□□□ 0.06
FCHO1-222ENST00000597718 MYH11P35749 1972 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 TRAK2O60296 914 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 RFX1P22670 979 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 ROR1Q01973 937 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 GRIN1Q05586 938 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 SPAG1Q07617 926 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 SLC10A6Q3KNW5 377 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 ARSHQ5FYA8 562 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 GPBP1Q86WP2 473 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 ING5Q8WYH8 240 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 FGF13Q92913 245 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 NXPE3Q969Y0 559 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 BICD1Q96G01 975 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 REEP2Q9BRK0 252 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 HAPLN2Q9GZV7 340 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 ZDHHC9Q9Y397 364 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 NUB1Q9Y5A7 615 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 CACNA1HO95180 2353 aa15.39■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 CITO14578 2027 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 VPS13AQ96RL7 3174 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 CLDN3O15551 220 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 CXCL8P10145 99 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 NCKAP1LP55160 1127 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 MCL1Q07820 350 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 UVSSAQ2YD98 709 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 ZPBP2Q6X784 338 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 CCDC105Q8IYK2 499 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 CALML4Q96GE6 196 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 RTP3Q9BQQ7 232 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 TBC1D17Q9HA65 648 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 KCND2Q9NZV8 630 aa15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 WDR27A2RRH5 827 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 PRRG1O14668 218 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 MBD3O95983 291 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 F13A1P00488 732 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 POU2F2P09086 479 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 PLCG1P19174 1290 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 RPL9P32969 192 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 UBA7P41226 1012 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 TNFSF9P41273 254 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 KARSQ15046 597 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 SLC8B1Q6J4K2 584 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 HAUS6Q7Z4H7 955 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 FRMD5Q7Z6J6 570 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 NPAS3Q8IXF0 933 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 KCTD17Q8N5Z5 321 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 DTWD2Q8NBA8 298 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 RASSF8Q8NHQ8 419 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 AK8Q96MA6 479 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 KXD1Q9BQD3 176 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 ARHGEF3Q9NR81 526 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 COL4A3Q01955 1670 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 MYH15Q9Y2K3 1946 aa15.37■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 K7ENM7 598 aa15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 SYN3O14994 580 aa15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 FAM13AO94988 1023 aa15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 KRT18P05783 430 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 RHOP08100 348 aa15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 LIG4P49917 911 aa15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 GPC5P78333 572 aa15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 PKP1Q13835 747 aa15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 MCM6Q14566 821 aa15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 GSE1Q14687 1217 aa15.36■□□□□ 0.05
FCHO1-222ENST00000597718 ANGPT1Q15389 498 aa15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms