RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583704.1

TTC19-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, humanhuman

TSL 2

Gene TTC19, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC19-210ENST00000583704 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa24.43■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 CNTN3Q9P232 1028 aa24.43■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 PROB1E7EW31 1015 aa24.42■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 KCNE1P15382 129 aa24.42■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 NBL1P41271 181 aa24.42■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 SLC12A3P55017 1021 aa24.42■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.42■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 UVSSAQ2YD98 709 aa24.42■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 SEZ6Q53EL9 994 aa24.42■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 DTWD2Q8NBA8 298 aa24.42■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 TBC1D17Q9HA65 648 aa24.42■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 FOXD4L1Q9NU39 408 aa24.42■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa24.41■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 TOM1L1O75674 476 aa24.41■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 POU2F2P09086 479 aa24.41■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 PLA2G4BP0C869 781 aa24.41■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 MAPTP10636 758 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 SYT1P21579 422 aa24.41■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 UBA7P41226 1012 aa24.41■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 SMTNP53814 917 aa24.41■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 TMEM119Q4V9L6 283 aa24.41■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 ASCL5Q7RTU5 278 aa24.41■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 ARHGEF3Q9NR81 526 aa24.41■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa24.41■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 ROR1Q01973 937 aa24.4■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 ANGPT1Q15389 498 aa24.4■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 FRMD5Q7Z6J6 570 aa24.4■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 CALML4Q96GE6 196 aa24.4■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 KCND2Q9NZV8 630 aa24.4■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 NUB1Q9Y5A7 615 aa24.4■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa24.4■■□□□ 1.5
TTC19-210ENST00000583704 SLC8B1Q6J4K2 584 aa24.39■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 ING5Q8WYH8 240 aa24.39■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 KCNG1Q9UIX4 513 aa24.39■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 WDR27A2RRH5 827 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 PRR23AA6NEV1 266 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 SYN3O14994 580 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 SLC26A4O43511 780 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 RPL9P32969 192 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 LONP1P36776 959 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 ARPP19P56211 112 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 GRIN1Q05586 938 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 SLC10A6Q3KNW5 377 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 ARSHQ5FYA8 562 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 ZPBP2Q6X784 338 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 MTSS1LQ765P7 747 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 RTL10Q7L3V2 364 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 NPAS3Q8IXF0 933 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 RASSF8Q8NHQ8 419 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 ZNF461Q8TAF7 563 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa24.38■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 COL4A3Q01955 1670 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 CLDN3O15551 220 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 CXCL8P10145 99 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 GPC5P78333 572 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 MCL1Q07820 350 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 RESTQ13127 1097 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 TMEM130Q8N3G9 435 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 LRRC15Q8TF66 581 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 BICD1Q96G01 975 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 KXD1Q9BQD3 176 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 HAPLN2Q9GZV7 340 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 KCNH3Q9ULD8 1083 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 CLIC4Q9Y696 253 aa24.37■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 TBC1D4O60343 1298 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 ABLIM3O94929 683 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 DCNP07585 359 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 RHOP08100 348 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 ELF1P32519 619 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 MCM4P33991 863 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 NCKAP1LP55160 1127 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 SLC5A9Q2M3M2 681 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 SPECC1Q5M775 1068 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 FAM173BQ6P4H8 233 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 SUSD3Q96L08 255 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 REEP2Q9BRK0 252 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 FBXL5Q9UKA1 691 aa24.36■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 ARHGEF37A1IGU5 675 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 H7C4K7 107 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 PRRG1O14668 218 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 LRG1P02750 347 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 SPAG1Q07617 926 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 GPBP1Q86WP2 473 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 FOXQ1Q9C009 403 aa24.35■■□□□ 1.49
TTC19-210ENST00000583704 ODF2LQ9ULJ1 636 aa24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms