RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568331.5

SNAP23-216, Transcript of synaptosome associated protein 23, humanhuman

TSL 4

Gene SNAP23, Length 557 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23-216ENST00000568331 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.92■■□□□ 1.26
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SNAP23-216ENST00000568331 TMEM206Q9H813 350 aa22.92■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.92■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SNAP23-216ENST00000568331 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
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SNAP23-216ENST00000568331 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
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SNAP23-216ENST00000568331 CUL4BQ13620 913 aa22.86■■□□□ 1.25
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SNAP23-216ENST00000568331 KREMEN2Q8NCW0 462 aa22.86■■□□□ 1.25
SNAP23-216ENST00000568331 POMKQ9H5K3 350 aa22.86■■□□□ 1.25
SNAP23-216ENST00000568331 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.86■■□□□ 1.25
SNAP23-216ENST00000568331 MTRRQ9UBK8 725 aa22.86■■□□□ 1.25
SNAP23-216ENST00000568331 CDH22Q9UJ99 828 aa22.86■■□□□ 1.25
SNAP23-216ENST00000568331 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.85■■□□□ 1.25
SNAP23-216ENST00000568331 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.85■■□□□ 1.25
SNAP23-216ENST00000568331 H7C4K7 107 aa22.85■■□□□ 1.25
SNAP23-216ENST00000568331 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SNAP23-216ENST00000568331 OR1D2P34982 312 aa22.85■■□□□ 1.25
SNAP23-216ENST00000568331 LILRA6Q6PI73 481 aa22.85■■□□□ 1.25
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