RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556256.1

SCFD1-218, Transcript of sec1 family domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SCFD1, Length 428 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCFD1-218ENST00000556256 ECHS1P30084 290 aa4.85□□□□□ -1.63
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SCFD1-218ENST00000556256 NOMO1Q15155 1222 aa4.84□□□□□ -1.63
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SCFD1-218ENST00000556256 INTS13Q9NVM9 706 aa4.81□□□□□ -1.64
SCFD1-218ENST00000556256 SCOCQ9UIL1 159 aa4.81□□□□□ -1.64
SCFD1-218ENST00000556256 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
SCFD1-218ENST00000556256 ACTL7AQ9Y615 435 aa4.81□□□□□ -1.64
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SCFD1-218ENST00000556256 LINC00473A8K010 186 aa4.8□□□□□ -1.64
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SCFD1-218ENST00000556256 PCSK1P29120 753 aa4.8□□□□□ -1.64
SCFD1-218ENST00000556256 TUBA4AP68366 448 aa4.8□□□□□ -1.64
SCFD1-218ENST00000556256 PTPRRQ15256 657 aa4.8□□□□□ -1.64
SCFD1-218ENST00000556256 TCEA2Q15560 299 aa4.8□□□□□ -1.64
SCFD1-218ENST00000556256 ADRM1Q16186 407 aa4.8□□□□□ -1.64
SCFD1-218ENST00000556256 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP4.8□□□□□ -1.64
SCFD1-218ENST00000556256 FAM180AQ6UWF9 173 aa4.8□□□□□ -1.64
SCFD1-218ENST00000556256 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa4.8□□□□□ -1.64
SCFD1-218ENST00000556256 RGMAQ96B86 450 aa4.8□□□□□ -1.64
SCFD1-218ENST00000556256 HAPLN3Q96S86 360 aa4.8□□□□□ -1.64
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