RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 NAT1P18440 290 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 GRK2P25098 689 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 GRK3P35626 688 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 PAK1Q13153 545 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 SEC23AQ15436 765 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 STEAP3Q658P3 488 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 APOA5Q6Q788 366 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 MFSD6Q6ZSS7 791 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 MFSD3Q96ES6 412 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 PGBD1Q96JS3 809 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 IPPKQ9H8X2 491 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 L2HGDHQ9H9P8 463 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 CD209Q9NNX6 404 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 POLLQ9UGP5 575 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 BCORQ6W2J9 1755 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ELP1O95163 1332 aa6.25□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 H3BQV1 296 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 H7BY64 318 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ARVCFO00192 962 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 GPR42O15529 346 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 OPA1O60313 960 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 CYP2D6P10635 497 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 IL1R1P14778 569 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 RXRAP19793 462 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 GUCY1B3Q02153 619 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ZNF460Q14592 562 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 SURF1Q15526 300 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 SBK1Q52WX2 424 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 TM4SF20Q53R12 229 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 EMC4Q5J8M3 183 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 CCDC183Q5T5S1 534 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 PKN3Q6P5Z2 889 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 Q8N1X5 172 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 TBC1D16Q8TBP0 767 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 AIFM3Q96NN9 605 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 USP28Q96RU2 1077 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 MYL10Q9BUA6 226 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 CD248Q9HCU0 757 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 CROTQ9UKG9 612 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 BTAF1O14981 1849 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 C4BP0C0L5 1744 aa6.24□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 SCN7AQ01118 1682 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 CCDC69A6NI79 296 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 GOLGA8AA7E2F4 631 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 KIF28PB7ZC32 967 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 UBE2Q2LH0YL09 131 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 CPLX1O14810 134 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ZBTB43O43298 467 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ORC4O43929 436 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ASLP04424 464 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 SRGNP10124 158 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 COL6A2P12110 1019 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 C6P13671 934 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 IFNAR1P17181 557 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 IGFALSP35858 605 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 MASP1P48740 699 aa6.23□□□□□ -1.41
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TRDN-205ENST00000546248 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 WTAPQ15007 396 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ATL3Q6DD88 541 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ABHD17CQ6PCB6 329 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ZNF804AQ7Z570 1209 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 TMTC2Q8N394 836 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 ESR2Q92731 530 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 C8orf76Q96K31 380 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 CLIC6Q96NY7 704 aa6.23□□□□□ -1.41
TRDN-205ENST00000546248 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.23□□□□□ -1.41
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