RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538333.3

LIMK1-208, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LIMK1, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-208ENST00000538333 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 IER5Q5VY09 327 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 KCTD16Q68DU8 428 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 TRIM50Q86XT4 487 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 TRIM7Q9C029 511 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 AZI2Q9H6S1 392 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 TMBIM4Q9HC24 238 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 GRIN2DO15399 1336 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 UMODL1Q5DID0 1318 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 ABLIM1O14639 778 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CLDN3O15551 220 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 TOM1L1O75674 476 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 IVLP07476 585 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CFHP08603 1231 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 TNFSF9P41273 254 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 IRAK1P51617 712 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 MTMR3Q13615 1198 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CEP85LQ5SZL2 805 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 TRIM11Q96F44 468 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 FMO2Q99518 471 aa14.98□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 MGAMO43451 1857 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 ANK1P16157 1881 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 PPFIA2O75334 1257 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 MARK3P27448 753 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 MAPK4P31152 587 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 NOMO3P69849 1222 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF844Q08AG5 666 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 GRM1Q13255 1194 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 PPIL2Q13356 520 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 NCOA4Q13772 614 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 TMEM270Q6UE05 265 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 UBR7Q8N806 425 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CDCA5Q96FF9 252 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 RNF181Q9P0P0 153 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 RARAP10276 462 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 HARSP12081 509 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 NSFP46459 744 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 SPDYCQ5MJ68 293 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 LLGL2Q6P1M3 1020 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 KDM7AQ6ZMT4 941 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 TRIM72Q6ZMU5 477 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 WDR49Q8IV35 697 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 OR2W6PQ8NHA6 318 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 TCP11Q8WWU5 503 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 RASAL2Q9UJF2 1139 aa14.97□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 GNA15P30679 374 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF132P52740 706 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 PLCB4Q15147 1175 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 C2CD6Q53TS8 623 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 RNF149Q8NC42 400 aa14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
LIMK1-208ENST00000538333 MYO1FO00160 1098 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 PODXLO00592 558 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 FSCN2O14926 492 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 ASS1P00966 412 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 COILP38432 576 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 SLC1A1P43005 524 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 AP3M2P53677 418 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 MCL1Q07820 350 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 PTP4A2Q12974 167 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 VCPIP1Q96JH7 1222 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 MMP19Q99542 508 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 SYT17Q9BSW7 474 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 LRRC19Q9H756 370 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 MTUS1Q9ULD2 1270 aa14.95□□□□□ -0.02
LIMK1-208ENST00000538333 SNX24Q9Y343 169 aa14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms