RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 C3orf58Q8NDZ4 430 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 PANK2Q9BZ23 570 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 MAGEF1Q9HAY2 307 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 CDH22Q9UJ99 828 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.08■□□□□ 0.81
TSPAN4-216ENST00000526055 ZMYND10O75800 440 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 WEE2P0C1S8 567 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 PAX3P23760 479 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 HOXA9P31269 272 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 RAB33AQ14088 237 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 E2F4Q16254 413 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 KANK3Q6NY19 840 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 PDILTQ8N807 584 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 STAMQ92783 540 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 KIF12Q96FN5 646 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 ACCSQ96QU6 501 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 KBTBD4Q9NVX7 518 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 DERAQ9Y315 318 aa20.07■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 C2CD4DB7Z1M9 353 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 IDEP14735 1019 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 TNFSF9P41273 254 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 BRCC3P46736 316 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 ZXDAP98168 799 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 PTPN21Q16825 1174 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 UVSSAQ2YD98 709 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 ADALQ6DHV7 355 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 CNNM4Q6P4Q7 775 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 SHC4Q6S5L8 630 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 SUSD3Q96L08 255 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 ASB7Q9H672 318 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 PANK4Q9NVE7 773 aa20.06■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 PLXNA3P51805 1871 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 LACTBL1A8MY62 500 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 H7C4K7 107 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 POU2F2P09086 479 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 PKP1Q13835 747 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 LIN9Q5TKA1 542 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC8B1Q6J4K2 584 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 APPL2Q8NEU8 664 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM13BQ9NYF5 915 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 VWA8A3KMH1 1905 aa20.05■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM86C2PA6NEL3 165 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 RFPL2O75678 378 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 GCNT3O95395 438 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 SPATA31D3P0C874 917 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 MCM4P33991 863 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 OR1D2P34982 312 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 ME1P48163 572 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 SPATA1Q5VX52 437 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 BEST2Q8NFU1 509 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 POMGNT1Q8WZA1 660 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 TRIM9Q9C026 710 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM206Q9H813 350 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 C2CD2Q9Y426 696 aa20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 CLUHO75153 1309 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 DENND4AQ7Z401 1863 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 I3L4J1 428 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 GARTP22102 1010 aa20.03■□□□□ 0.8
TSPAN4-216ENST00000526055 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.03■□□□□ 0.88e-6■■■■■ 52.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms