RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505553.5

TRAPPC13-208, Transcript of trafficking protein particle complex 13, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC13, Length 1,410 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAPPC13-208	ENST00000505553	KIT	P10721	976 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	CTSS	P25774	331 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	MC3R	P41968	323 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	GRM1	Q13255	1194 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	SEPT2	Q15019	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	STIL	Q15468	1287 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	CDK5RAP1	Q96SZ6	601 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	USP19	O94966	1318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	SRGN	P10124	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	PER3	P56645	1201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	PMS2P11	Q13670	270 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	RNF152	Q8N8N0	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	SKA1	Q96BD8	255 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	ARHGAP20	Q9P2F6	1191 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	CPA4	Q9UI42	421 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553		A0A1W2PPC4	97 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553		A0A1W2PR48	441 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553		M0R3H8	397 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	MAL	P21145	153 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	TGM1	P22735	817 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	STAT5A	P42229	794 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	HSPA7	P48741	367 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	ALDH9A1	P49189	494 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	IL13RA1	P78552	427 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	MPEG1	Q2M385	716 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	RFX8	Q6ZV50	586 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	DTX3	Q8N9I9	347 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	NAXE	Q8NCW5	288 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	SNX33	Q8WV41	574 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	ZNF566	Q969W8	418 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	TMX3	Q96JJ7	454 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	TMEM209	Q96SK2	561 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	SOX7	Q9BT81	388 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	PCDH18	Q9HCL0	1135 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	NTM	Q9P121	344 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	FBXO10	Q9UK96	956 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	LAS1L	Q9Y4W2	734 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	PLA2G6	O60733	806 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	PRAMEF4	O60810	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TRAPPC13-208	ENST00000505553	TMEM127	O75204	238 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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