RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 SREBF2Q12772 1141 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 TRAF1Q13077 416 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 GRB10Q13322 594 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 CALCRLQ16602 461 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 ARHGEF16Q5VV41 709 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 CCDC62Q6P9F0 684 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM181AQ8N9Y4 354 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 FSIP1Q8NA03 581 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 TRPV1Q8NER1 839 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 KCNG4Q8TDN1 519 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 COPS5Q92905 334 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 PANK2Q9BZ23 570 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 UNC45AQ9H3U1 944 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 KCNH7Q9NS40 1196 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 FAM86C1Q9NVL1 165 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 FBXO40Q9UH90 709 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 PNMA2Q9UL42 364 aa6.9□□□□□ -1.3
RABGGTB-212ENST00000491266 MYH6P13533 1939 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 SIGLEC6O43699 453 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 MED24O75448 989 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 STBD1O95210 358 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 HOXC6P09630 235 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 NAT2P11245 290 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 FCER1AP12319 257 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 HSPA6P17066 643 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 CASP1P29466 404 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 ICAM3P32942 547 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 TECP42680 631 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 ZNF445P59923 1031 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 PSMC6P62333 389 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 KARSQ15046 597 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 UGCGQ16739 394 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 LONRF3Q496Y0 759 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 WDR78Q5VTH9 848 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 MCTP2Q6DN12 878 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 SPATC1Q76KD6 591 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 ARMCX2Q7L311 632 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 OTOP1Q7RTM1 612 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 NIPA1Q7RTP0 329 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 TMC3Q7Z5M5 1100 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 DNERQ8NFT8 737 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 MAML3Q96JK9 1138 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 PCYT2Q99447 389 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 PLIN2Q99541 437 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 HDAC8Q9BY41 377 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 MAF1Q9H063 256 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 DACT1Q9NYF0 836 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 ZMYM5Q9UJ78 669 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 PFASO15067 1338 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 THSD7BQ9C0I4 1608 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 SHISA3A0PJX4 238 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 CCDC85CA6NKD9 419 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 TBX3O15119 743 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 CYP26A1O43174 497 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 STRNO43815 780 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 MAPK4P31152 587 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 COPB2P35606 906 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 PSMC4P43686 418 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 CLCN7P51798 805 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 CCNA1P78396 465 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 PRKCZQ05513 592 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 KCTD2Q14681 263 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 TCEAL1Q15170 157 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 MSMPQ1L6U9 139 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 KLHL40Q2TBA0 621 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 TMEM119Q4V9L6 283 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 GAS2L3Q86XJ1 694 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGGTB-212ENST00000491266 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms