RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
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C9orf3-215ENST00000478473 TBC1D4O60343 1298 aa25.53■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 F13A1P00488 732 aa25.53■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 HOXA9P31269 272 aa25.53■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 BRCC3P46736 316 aa25.53■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 E2F4Q16254 413 aa25.53■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 OTOP3Q7RTS5 596 aa25.53■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 DYMQ7RTS9 669 aa25.53■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 SFR1Q86XK3 245 aa25.53■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 CD302Q8IX05 232 aa25.53■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 PRKD2Q9BZL6 878 aa25.53■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 ZHX3Q9H4I2 956 aa25.53■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 TKTP29401 623 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 TNFSF9P41273 254 aa25.52■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 STAT6P42226 847 aa25.52■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 SIGLEC14Q08ET2 396 aa25.52■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 SLFN12LQ6IEE8 588 aa25.52■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 SLC8B1Q6J4K2 584 aa25.52■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 SUSD3Q96L08 255 aa25.52■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 CUEDC2Q9H467 287 aa25.52■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.52■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
C9orf3-215ENST00000478473 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.51■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 ANKRD63C9JTQ0 380 aa25.51■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 CUTAO60888 179 aa25.51■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 SPATA31D3P0C874 917 aa25.51■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.673e-6■□□□□ 11.2
C9orf3-215ENST00000478473 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 UVSSAQ2YD98 709 aa25.51■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa25.51■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa25.51■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 MSTO1Q9BUK6 570 aa25.51■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 KBTBD4Q9NVX7 518 aa25.51■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 SORCS3Q9UPU3 1222 aa25.51■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 LACTBL1A8MY62 500 aa25.5■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.5■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 ALCAMQ13740 583 aa25.5■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 CNNM4Q6P4Q7 775 aa25.5■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 HFE2Q6ZVN8 426 aa25.5■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 GLYCTKQ8IVS8 523 aa25.5■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 UBALD2Q8IYN6 164 aa25.5■■□□□ 1.67
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C9orf3-215ENST00000478473 I3L4J1 428 aa25.49■■□□□ 1.67
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C9orf3-215ENST00000478473 OR1D2P34982 312 aa25.49■■□□□ 1.67
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C9orf3-215ENST00000478473 SHC4Q6S5L8 630 aa25.49■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 KCNG4Q8TDN1 519 aa25.49■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 STAMQ92783 540 aa25.49■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 PANK2Q9BZ23 570 aa25.49■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 ASB7Q9H672 318 aa25.49■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 MYO10Q9HD67 2058 aa25.48■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM221A6NGB7 291 aa25.48■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 M0QZQ0 153 aa25.48■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 M0R296 226 aa25.48■■□□□ 1.67
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C9orf3-215ENST00000478473 PKP1Q13835 747 aa25.48■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 POSTNQ15063 836 aa25.48■■□□□ 1.67
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C9orf3-215ENST00000478473 KIF12Q96FN5 646 aa25.48■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.48■■□□□ 1.67
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C9orf3-215ENST00000478473 EPS15L1Q9UBC2 864 aa25.48■■□□□ 1.67
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C9orf3-215ENST00000478473 MTMR3Q13615 1198 aa25.47■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 LIN9Q5TKA1 542 aa25.47■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF461Q8TAF7 563 aa25.47■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 MFSD14AQ96MC6 490 aa25.47■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 KCNH6Q9H252 994 aa25.47■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 RCOR1Q9UKL0 485 aa25.47■■□□□ 1.67
C9orf3-215ENST00000478473 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
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