RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.28■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 PALB2Q86YC2 1186 aa22.28■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 BEST2Q8NFU1 509 aa22.28■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 FBXL18Q96ME1 805 aa22.28■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 TSPAN18Q96SJ8 248 aa22.28■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 LILRB3O75022 631 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 RTP2Q5QGT7 225 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 CNNM4Q6P4Q7 775 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 GPR65Q8IYL9 337 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 GJD3Q8N144 294 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 SLC22A17Q8WUG5 538 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 HPS3Q969F9 1004 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 RIPOR3Q96MK2 946 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 FAM213AQ9BRX8 229 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 STRA6Q9BX79 667 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 RXFP1Q9HBX9 757 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 EXOC1Q9NV70 894 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 FNIP2Q9P278 1114 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.27■■□□□ 1.16
SCAF8-204ENST00000461219 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.26■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.26■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 I3L4J1 428 aa22.26■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 EFEMP2O95967 443 aa22.26■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 CASP1P29466 404 aa22.26■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 BRCC3P46736 316 aa22.26■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 CUL4BQ13620 913 aa22.26■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 JADE1Q6IE81 842 aa22.26■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 SYCE2Q6PIF2 218 aa22.26■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 PAGE5Q96GU1 130 aa22.26■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa22.26■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 IKZF4Q9H2S9 585 aa22.26■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.26■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 C2orf16Q68DN1 1984 aa22.26■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 VCANP13611 3396 aa22.25■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 A0A1W2PQ27 194 aa22.25■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 A0A1W2PQ64 194 aa22.25■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 A0A1W2PQD8 194 aa22.25■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 IL18RAPO95256 599 aa22.25■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 GARTP22102 1010 aa22.25■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 MTHFRP42898 656 aa22.25■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 NDUFA8P51970 172 aa22.25■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 ATAT1Q5SQI0 421 aa22.25■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.25■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22.25■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 SAAL1Q96ER3 474 aa22.25■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 NECTIN4Q96NY8 510 aa22.25■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.25■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 PCIF1Q9H4Z3 704 aa22.25■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 ASB7Q9H672 318 aa22.25■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 UBE4BO95155 1302 aa22.25■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 FAM189A1O60320 539 aa22.24■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 SPATA31D3P0C874 917 aa22.24■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 CYP3A5P20815 502 aa22.24■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 TKTP29401 623 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 ZP2Q05996 745 aa22.24■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 TMC5Q6UXY8 1006 aa22.24■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.24■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.24■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 NELFCDQ8IXH7 590 aa22.24■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 S1PR5Q9H228 398 aa22.24■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 SLC39A2Q9NP94 309 aa22.24■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.24■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 DERAQ9Y315 318 aa22.24■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 MYL1P05976 194 aa22.23■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 NFICP08651 508 aa22.23■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 FGFR3P22607 806 aa22.23■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 ADSSP30520 456 aa22.23■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 LIN9Q5TKA1 542 aa22.23■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.23■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 HS2ST1Q7LGA3 356 aa22.23■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 APPL2Q8NEU8 664 aa22.23■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa22.23■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 HPSEQ9Y251 543 aa22.23■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 TTC28Q96AY4 2481 aa22.23■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 GOLGA8IPA6NC78 632 aa22.22■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 GOLGA8JA6NMD2 632 aa22.22■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 H7C4K7 107 aa22.22■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 SYN3O14994 580 aa22.22■■□□□ 1.15
SCAF8-204ENST00000461219 TGM5O43548 720 aa22.22■■□□□ 1.15
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