RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422939.1

TRPS1-204, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRPS1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-204ENST00000422939 FOSP01100 380 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 BLOC1S1P78537 153 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 CDC42EP1Q00587 391 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 CREMQ03060 361 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 OCA2Q04671 838 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 FAM43AQ8N2R8 423 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 FITM2Q8N6M3 262 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 SUPT20HQ8NEM7 779 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 GPR150Q8NGU9 434 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 BOD1Q96IK1 185 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 TEKT5Q96M29 485 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 RNF181Q9P0P0 153 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 IPPQ9Y573 584 aa7.3□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 OVOL3O00110 214 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 SGTAO43765 313 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 FGFR4P22455 802 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 TGM1P22735 817 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 AVPR1BP47901 424 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 RSPH3Q86UC2 560 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 NUP133Q8WUM0 1156 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 COA7Q96BR5 231 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 ZG16BQ96DA0 208 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 PCDH12Q9NPG4 1184 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 TMEM74BQ9NUR3 256 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.29□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 GPANK1O95872 356 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 HKR1P10072 659 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 EDNRBP24530 442 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 FOXR2Q6PJQ5 311 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 IFI44Q8TCB0 444 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 ASB10Q8WXI3 467 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 TMX3Q96JJ7 454 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 TNKSO95271 1327 aa7.27□□□□□ -1.24
TRPS1-204ENST00000422939 CCDC78A2IDD5 438 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 LMNAP02545 664 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 CXADRP78310 365 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 HSD11B2P80365 405 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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TRPS1-204ENST00000422939 GALNT9Q9HCQ5 603 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 KCNE5Q9UJ90 142 aa7.27□□□□□ -1.25
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TRPS1-204ENST00000422939 AATKQ6ZMQ8 1374 aa7.27□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 CDHR4A6H8M9 788 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 CCDC154A6NI56 674 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 ITGAMP11215 1152 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 ADRA1BP35368 520 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 NOMO3P69849 1222 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 SCAPQ12770 1279 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 IL10RAQ13651 578 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 PTPN21Q16825 1174 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 C3orf36Q3SXR2 165 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 NOMO2Q5JPE7 1267 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 PPP4R3AQ6IN85 833 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 GPR149Q86SP6 731 aa7.26□□□□□ -1.25
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TRPS1-204ENST00000422939 RNF31Q96EP0 1072 aa7.26□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 USP25Q9UHP3 1055 aa7.26□□□□□ -1.25
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TRPS1-204ENST00000422939 BMP5P22003 454 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 SEC24CP53992 1094 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 ADKP55263 362 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 RAB39AQ14964 217 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 ODF1Q14990 250 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 OLFML1Q6UWY5 402 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 IL17RDQ8NFM7 739 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 TBC1D15Q8TC07 691 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 NACC2Q96BF6 587 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 MED15Q96RN5 788 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa7.25□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 MYADML2A6NDP7 307 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 GRM6O15303 877 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 HAUS5O94927 633 aa7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TRPS1-204ENST00000422939 CCND1P24385 295 aa7.24□□□□□ -1.25
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