RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 TOM1L1O75674 476 aa21.45■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 DCNP07585 359 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 PLS3P13797 630 aa21.45■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 RPL9P32969 192 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 SMTNP53814 917 aa21.45■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 NPAS3Q8IXF0 933 aa21.45■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 KCTD17Q8N5Z5 321 aa21.45■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa21.45■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 ING5Q8WYH8 240 aa21.45■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa21.45■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 CITO14578 2027 aa21.45■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 NOTCH4Q99466 2003 aa21.45■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 WDR27A2RRH5 827 aa21.44■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 H3BQV1 296 aa21.44■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 SYN3O14994 580 aa21.44■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 ABLIM3O94929 683 aa21.44■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 GJB2P29033 226 aa21.44■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 ELF1P32519 619 aa21.44■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 ARPP19P56211 112 aa21.44■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 SLC10A6Q3KNW5 377 aa21.44■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 SEZ6Q53EL9 994 aa21.44■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 SHDQ96IW2 340 aa21.44■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 TMX3Q96JJ7 454 aa21.44■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 KXD1Q9BQD3 176 aa21.44■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 MYH11P35749 1972 aa21.43■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 H7C4K7 107 aa21.43■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 PRRG1O14668 218 aa21.43■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D4O60343 1298 aa21.43■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 LRG1P02750 347 aa21.43■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 RHOP08100 348 aa21.43■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 PLA2G4BP0C869 781 aa21.43■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 MAPTP10636 758 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 SLC12A3P55017 1021 aa21.43■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 STARD6P59095 220 aa21.43■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 ZPBP2Q6X784 338 aa21.43■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 FOXQ1Q9C009 403 aa21.43■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 KCND2Q9NZV8 630 aa21.43■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa21.43■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa21.42■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.42■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 CLDN3O15551 220 aa21.42■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 ATF2P15336 505 aa21.42■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 PTPN2P17706 415 aa21.42■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 MCM4P33991 863 aa21.42■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 SLC5A9Q2M3M2 681 aa21.42■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 PJA1Q8NG27 643 aa21.42■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 MCRS1Q96EZ8 462 aa21.42■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 SUSD3Q96L08 255 aa21.42■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 FBXL5Q9UKA1 691 aa21.42■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.41■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 MCL1Q07820 350 aa21.41■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 CTXN3Q4LDR2 81 aa21.41■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM119Q4V9L6 283 aa21.41■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.41■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 TCEAL8Q8IYN2 117 aa21.41■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 ADSSL1Q8N142 457 aa21.41■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.41■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 CYP4F11Q9HBI6 524 aa21.41■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa21.41■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 COL4A3Q01955 1670 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 KANSL1LA0AUZ9 987 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 LRRN2O75325 713 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 SEC24AO95486 1093 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 CXCL8P10145 99 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 PFKPQ01813 784 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 ARSHQ5FYA8 562 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF280DQ6N043 979 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 DDX12PQ92771 950 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 BICD1Q96G01 975 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 CORO1BQ9BR76 489 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 HAPLN2Q9GZV7 340 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 GDE1Q9NZC3 331 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 INSL5Q9Y5Q6 135 aa21.4■■□□□ 1.02
CXCL3-201ENST00000296026 H0YCG3 227 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 GLULP15104 373 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 CEBPBP17676 345 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 NCKAP1LP55160 1127 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 PRKCQQ04759 706 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 SPAG1Q07617 926 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 TPGS2Q68CL5 300 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 POTEHQ6S545 545 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 HAUS6Q7Z4H7 955 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 C1orf210Q8IVY1 113 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 APPL2Q8NEU8 664 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 R4GN57 208 aa21.39■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 ECI2O75521 394 aa21.38■■□□□ 1.01
CXCL3-201ENST00000296026 CLTAP09496 248 aa21.38■■□□□ 1.01
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