RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa16.22■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa16.22■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 SPDYE5A6NIY4 337 aa16.22■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 BANF1O75531 89 aa16.22■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 INHBAP08476 426 aa16.22■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 RRM1P23921 792 aa16.22■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 PPP4CP60510 307 aa16.22■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 AP3B2Q13367 1082 aa16.22■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 SLFN11Q7Z7L1 901 aa16.22■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa16.22■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 C10orf88Q9H8K7 445 aa16.22■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 ZWILCHQ9H900 591 aa16.22■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 TMOD2Q9NZR1 351 aa16.22■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 PLCH1Q4KWH8 1693 aa16.22■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 ATP2B4P23634 1241 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 PGM1P36871 562 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 PPATQ06203 517 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 PPP3CAQ08209 521 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 SNX30Q5VWJ9 437 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 CENPUQ71F23 418 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 CBWD2Q8IUF1 395 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 SLC25A41Q8N5S1 370 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 FAM13CQ8NE31 585 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 RNF217Q8TC41 542 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 OSBPL8Q9BZF1 889 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 IMPG2Q9BZV3 1241 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 SLC13A1Q9BZW2 595 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 ADAM7Q9H2U9 754 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 H3BRJ5 948 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 RIPK1Q13546 671 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 EMC10Q5UCC4 262 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 RHPN2Q8IUC4 686 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 SLIT2O94813 1529 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 TLR3O15455 904 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 ATP9AO75110 1047 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 ETS1P14921 441 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 MTFR1Q15390 333 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 C1orf146Q5VVC0 180 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 TMEM270Q6UE05 265 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 CYP4F11Q9HBI6 524 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 KCNQ5Q9NR82 932 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 USP20Q9Y2K6 914 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa16.21■□□□□ 0.19
USP25-201ENST00000285679 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PCNX4Q63HM2 1172 aa16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 HAUS6Q7Z4H7 955 aa16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 LRRC4BQ9NT99 713 aa16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PHBP35232 272 aa16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PRELPP51888 382 aa16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 MARSP56192 900 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 MPP2Q14168 576 aa16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 VSTM1Q6UX27 236 aa16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 ZNF720Q7Z2F6 126 aa16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CCDC110Q8TBZ0 833 aa16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 SLC5A4Q9NY91 659 aa16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 KIF3CO14782 793 aa16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PTGIRP43119 386 aa16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 ART4Q93070 314 aa16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 FAM213AQ9BRX8 229 aa16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 THTPAQ9BU02 230 aa16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 MKNK1Q9BUB5 465 aa16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PCYOX1Q9UHG3 505 aa16.2■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 KRT36O76013 467 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 TMPRSS15P98073 1019 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 FAM196AQ6ZSG2 479 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PCDHB18PQ96TA0 734 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CYP39A1Q9NYL5 469 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 NARFQ9UHQ1 456 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 C2orf71A6NGG8 1288 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 ADRA1DP25100 572 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 FOXN2P32314 431 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PEX5P50542 639 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CFAP36Q96G28 342 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 TMEM206Q9H813 350 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 DOT1LQ8TEK3 1739 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 ALAS1P13196 640 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 CYP11B1P15538 503 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 TAC1P20366 129 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 HOXD13P35453 343 aa16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
USP25-201ENST00000285679 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms