RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 USP21Q9UK80 565 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PCM1Q15154 2024 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 KRT75O95678 551 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 APBA3O96018 575 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 GPD1LQ8N335 351 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 CYGBQ8WWM9 190 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 IFT43Q96FT9 208 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SPATA17Q96L03 361 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 RMI1Q9H9A7 625 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 UNC13BO14795 1591 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 F5H6K3 240 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 M0QYV0 167 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ANGPT2O15123 496 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 BNIP3LO60238 219 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ASNSP08243 561 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SOX11P35716 441 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ITGA8P53708 1063 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 KLRC3Q07444 240 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PTK7Q13308 1070 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 BTNL9Q6UXG8 535 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SPATA18Q8TC71 538 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 AGAP3Q96P47 875 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SERPINB12Q96P63 405 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PKD2L2Q9NZM6 624 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 NAGPAQ9UK23 515 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 MYO3AQ8NEV4 1616 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 H3BQF6 201 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 METTL23Q86XA0 190 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 C18orf8Q96DM3 657 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ERGIC2Q96RQ1 377 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PDHBP11177 359 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 GPC3P51654 580 aa6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PJA2O43164 708 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 APOA1P02647 267 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 MLH1P40692 756 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SNX19Q92543 992 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 USP6NLQ92738 828 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 MCEEQ96PE7 176 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 OSBPL8Q9BZF1 889 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 NQO1P15559 274 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SKOR1P84550 965 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 STX3Q13277 289 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 GRAPQ13588 217 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SWSAP1Q6NVH7 229 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PID1Q7Z2X4 250 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 NUP93Q8N1F7 819 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 COG4Q9H9E3 785 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 MYMKA6NI61 221 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 COMTP21964 271 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 CIITAP33076 1130 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 KCNMA1Q12791 1236 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 MAPK7Q13164 816 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 MAPRE2Q15555 327 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ATG9AQ7Z3C6 839 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 FAM160B2Q86V87 743 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 PXDNLA1KZ92 1463 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ARHGEF9O43307 516 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 HUS1O60921 280 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 MAGEA4P43358 317 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ITIH4Q14624 930 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 LRRC34Q8IZ02 419 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 C3orf20Q8ND61 904 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 NSL1Q96IY1 281 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ZBTB18Q99592 522 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 BFARQ9NZS9 450 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 RAD17O75943 681 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 SASH3O75995 380 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 ATP6V1G2O95670 118 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 OVGP1Q12889 678 aa6.66□□□□□ -1.34
SBNO1-201ENST00000267176 LAMB3Q13751 1172 aa6.66□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms