RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000214095.1

Ubp1-204, Transcript of Upstream-binding protein 1, mousemouse

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubp1, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zswim6Q80TB7 1207 aa23.99■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1499Q8VG65 314 aa23.99■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ces1fQ91WU0 561 aa23.99■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ndfip2Q91ZP6 311 aa23.99■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PawrQ925B0 333 aa23.99■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf654Q9DAU9 571 aa23.99■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gpatch1Q9DBM1 930 aa23.99■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 SerhlQ9EPB5 311 aa23.99■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Has3O08650 554 aa23.99■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Actr2P61161 394 aa23.99■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pid1Q3UBG2 217 aa23.99■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm11437Q5QR91 290 aa23.99■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Sema5bQ60519 1093 aa23.99■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Wrap53Q8VC51 532 aa23.99■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Olfr1502Q8VG66 316 aa23.99■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmem206Q9D771 350 aa23.99■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cst12Q9DAN8 128 aa23.99■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pdzd4Q9QY39 772 aa23.99■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Plcg1Q62077 1302 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 EloblA6PWE0 161 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Apol7bB1AQP7 369 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 AunipE9Q6Z5 340 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Bmp2P21274 394 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PtpreP49446 699 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kmt5aQ2YDW7 349 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Apol7eQ3UZ24 369 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 C2cd2lQ80X80 706 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cfap36Q8C6E0 343 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Shtn1Q8K2Q9 631 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rassf9Q8K342 435 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc137Q8R0K4 290 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rnf135Q9CWS1 417 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rnf14Q9JI90 485 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Myh9Q8VDD5 1960 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rad54lP70270 747 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zswim5Q80TC6 1188 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Il33Q8BVZ5 266 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rell1Q8K2J7 272 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 SncbQ91ZZ3 133 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 IydQ9DCX8 285 aa23.98■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Cyp2b9P12790 491 aa23.97■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ptgs2Q05769 604 aa23.97■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pih1d3Q3KNI6 218 aa23.97■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Wdr18Q4VBE8 431 aa23.97■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tmc8Q7TN58 722 aa23.97■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rhobtb2Q91V93 728 aa23.97■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Emc2Q9CRD2 297 aa23.97■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Arih1Q9Z1K5 555 aa23.97■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Clca3bE9PUL3 1044 aa23.96■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Adamts18Q4VC17 1219 aa23.96■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Phactr4Q501J7 694 aa23.96■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Soat1Q61263 540 aa23.96■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PrimpolQ6P1E7 537 aa23.96■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Osbpl2Q8BX94 484 aa23.96■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 ClasrpQ8CFC7 668 aa23.96■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Stoml1Q8CI66 399 aa23.96■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 DnerQ8JZM4 737 aa23.96■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Abcf3Q8K268 709 aa23.96■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Spc24Q9D083 201 aa23.96■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Snx19Q6P4T1 997 aa23.96■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 LnpkQ7TQ95 425 aa23.96■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 SnphQ80U23 495 aa23.96■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pard6bQ9JK83 371 aa23.96■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Abcb11Q9QY30 1321 aa23.96■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Wdr95D3Z7A8 784 aa23.95■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Rab21P35282 222 aa23.95■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Mmp20P57748 482 aa23.95■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Foxp2P58463 714 aa23.95■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pak4Q8BTW9 593 aa23.95■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dhx32Q8BZS9 744 aa23.95■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 HlcsQ920N2 722 aa23.95■■□□□ 1.43
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Plekhg4A0A1L1SU27 1217 aa23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ccdc152E9PX14 254 aa23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 PdgfraP26618 1089 aa23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 4930502E18RikQ14BQ3 236 aa23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Q6DFW0 481 aa23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Znf579Q80VM4 562 aa23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 B3glctQ8BHT6 489 aa23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Tcaf1Q8BNE1 924 aa23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Senp7Q8BUH8 1037 aa23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Dus1lQ8C2P3 475 aa23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Hectd2Q8CDU6 774 aa23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 C8aQ8K182 587 aa23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Trappc12Q8K2L8 797 aa23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nrbp2Q91V36 499 aa23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Foxp3Q99JB6 429 aa23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Q99KU6 348 aa23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zfp623Q9CY99 499 aa23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 IqcdQ9D3V1 458 aa23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nop56Q9D6Z1 580 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ttc17E9PVB5 1198 aa23.94■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Srebf2Q3U1N2 1130 aa23.94■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa23.94■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Ankfy1Q810B6 1169 aa23.94■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Zfp120Q8BZW4 436 aa23.94■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Gm21962L7N280 338 aa23.94■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Nub1P54729 614 aa23.94■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Eef1dP57776 281 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Pla2g6P97819 807 aa23.94■■□□□ 1.42
Ubp1-204ENSMUST00000214095 Kcnk18Q6VV64 394 aa23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.8 ms