RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000063006.11

Ccdc42-201, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Ccdc42, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PighQ5M9N4 188 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Klra7Q60654 280 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Samhd1Q60710 627 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MmeQ61391 750 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dsg1aQ61495 1057 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mysm1Q69Z66 819 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Retreg2Q6NS82 541 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mbtd1Q6P5G3 631 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tlr11Q6R5P0 926 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gigyf2Q6Y7W8 1291 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cfap100Q80VN0 613 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q8BGD0 127 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wdr3Q8BHB4 942 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 B3glctQ8BHT6 489 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Haus1Q8BHX1 278 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dpp9Q8BVG4 862 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ccser1Q8C0C4 895 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Taf2Q8C176 1104 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Apol9bQ8C7I4 310 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 P3h4Q8K2B0 443 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Apol9aQ8VDU3 310 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TraipQ8VIG6 470 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Srgap2Q91Z67 1071 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ferd3lQ923Z4 168 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Six6os1Q9CTN5 574 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Snx10Q9CWT3 201 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Arl2bpQ9D385 163 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 1700123K08RikQ9D991 295 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zfyve19Q9DAZ9 389 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pold3Q9EQ28 462 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hsd3b7Q9EQC1 369 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Stk4Q9JI11 487 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fmnl1Q9JL26 1094 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Trpc3Q9QZC1 836 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dnajc12Q9R022 198 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gyg1Q9R062 333 aa9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Smchd1Q6P5D8 2007 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ptpn3A2ALK8 913 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Mroh9G5E8L9 891 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Vmn2r77L7N2B7 854 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Xbp1O35426 267 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Enc1O35709 589 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hoxb8P09632 243 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 TxnP10639 105 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gnrh1P13562 90 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Serpinh1P19324 417 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NsfP46460 744 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Gfpt1P47856 697 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Btg3P50615 252 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Oaz1P54369 227 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 NcanP55066 1268 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 AdkP55264 361 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Capza3P70190 299 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Anp32eP97822 260 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Upf3bQ3ULL6 472 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cracr2aQ3UP38 310 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Znf532Q6NXK2 1036 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tas2r134Q7TQB0 298 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Srrm3Q80WV7 648 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Usp6nlQ80XC3 819 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Q8BGC1 442 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Dars2Q8BIP0 653 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kcnv1Q8BZN2 503 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Commd10Q8JZY2 202 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pop1Q8K205 1045 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ablim1Q8K4G5 861 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Pcdhb17Q91VD8 799 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Kdm8Q9CXT6 414 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Med7Q9CZB6 233 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 MlklQ9D2Y4 472 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 4930548H24RikQ9D496 437 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Tmem86aQ9D8N3 241 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 IvdQ9JHI5 424 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 PigoQ9JJI6 1093 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nudt5Q9JKX6 218 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cdc42ep4Q9JM96 349 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 EmcnQ9R0H2 261 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cul1Q9WTX6 776 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Akt3Q9WUA6 479 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Peg12Q9WVA7 283 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Grk1Q9WVL4 564 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Szt2A2A9C3 3431 aa9.87□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Fam81bA0A140LI28 432 aa9.86□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Wdr72D3YYM4 1114 aa9.86□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Spata31d1dE9Q5W2 1247 aa9.86□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 DgkkE9Q7N4 1118 aa9.86□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cops5O35864 334 aa9.86□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ptp4a2O70274 167 aa9.86□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Nr3c1P06537 783 aa9.86□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Cyp2f2P33267 491 aa9.86□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Slc12a1P55014 1095 aa9.86□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Foxp2P58463 714 aa9.86□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Hoxb13P70321 286 aa9.86□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Samd11Q1RNF8 542 aa9.86□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 ZufspQ3T9Z9 577 aa9.86□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rmdn3Q3UJU9 470 aa9.86□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Ttc9Q3V038 219 aa9.86□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Krt35Q497I4 455 aa9.86□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Rhox12Q4TU81 186 aa9.86□□□□□ -0.83
Ccdc42-201ENSMUST00000063006 Zbtb8osQ505B7 168 aa9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 29.8 ms