RNA–Protein interactions for RNA: 15S_rRNA

15S_rRNA, Transcript of Ribosomal RNA of the small mitochondrial ribosomal subunit, yeastyeast

Gene 15S_rRNA, Length 1,649 nt, Biotype rRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
15S_rRNA15S_rRNA DDI2P0CH63 225 aa1.53□□□□□ -2.16
15S_rRNA15S_rRNA DDI3P0CH64 225 aa1.53□□□□□ -2.16
15S_rRNA15S_rRNA YCR016WP25617 290 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
15S_rRNA15S_rRNA SRB4P32569 687 aa1.53□□□□□ -2.16
15S_rRNA15S_rRNA YHR180WP38868 163 aa1.53□□□□□ -2.16
15S_rRNA15S_rRNA DID2P69771 204 aa1.53□□□□□ -2.16
15S_rRNA15S_rRNA BCY1P07278 416 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA SVP26P38869 228 aa1.52□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA PEX17P40155 199 aa1.52□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA PRM10P42946 383 aa1.52□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA SPT3P06844 337 aa1.51□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA VPS21P36017 210 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA YER135CP40082 130 aa1.51□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA RPC17P47076 161 aa1.51□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA ERV29P53337 310 aa1.51□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA DCN1Q12395 269 aa1.51□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA LSO2Q3E772 92 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA CDC8P00572 216 aa1.51□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA NTF2P33331 125 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA MSN4P33749 630 aa1.51□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA TRM9P49957 279 aa1.51□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA NSA1P53136 463 aaPredicted RBP1.51□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA YMD8Q03697 442 aa1.51□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA YHR139C-AO13536 103 aa1.5□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA PET9P18239 318 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA CDC10P25342 322 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA AVT2P39981 480 aa1.5□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA COX15P40086 486 aa1.5□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA PRE6P40303 254 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA LIA1P47120 325 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA TOS8P53147 276 aa1.5□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA YNR062CP53748 327 aa1.5□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA BUD25P85052 153 aa1.5□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA PSF1Q12488 208 aa1.5□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA MEI4P29467 408 aa1.49□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA RPL33BP41056 107 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA YNL010WP53981 241 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP1.48□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA MATALPHA1P0CY06 175 aa1.48□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA HMLALPHA1P0CY07 175 aa1.48□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA DOG2P38773 246 aa1.48□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA ICE2P40499 491 aa1.48□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA AGE2P40529 298 aa1.48□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA NOP13P53883 403 aaKnown RBP RIP-Chip data1.48□□□□□ -2.17not detected
15S_rRNA15S_rRNA YPR170W-BP0C5R9 85 aa1.48□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA YOL162WP0CF19 215 aa1.48□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA SSO1P32867 290 aa1.48□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA IRC22P40006 225 aa1.48□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA YER085CP40058 173 aa1.48□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA PGD1P40356 397 aa1.48□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA REP2P03872 296 aa1.47□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA URA6P15700 204 aa1.47□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA RPL24BP24000 155 aaKnown RBP1.47□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA TIR3P40552 269 aa1.47□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA MIC26P50087 233 aa1.47□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA AIF1P52923 378 aa1.47□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA FYV6P53913 173 aa1.47□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA TRM12Q04235 462 aa1.47□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA SML1Q04964 104 aa1.47□□□□□ -2.17
15S_rRNA15S_rRNA VMA6P32366 345 aaKnown RBP1.46□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA PRM8P53174 237 aa1.46□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA LPP1Q04396 274 aa1.46□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA YGL010WP25338 174 aa1.45□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA ATG22P25568 528 aa1.45□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA SRY1P36007 326 aa1.45□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA YKR045CP36138 183 aa1.45□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA YBR219CP38317 127 aa1.45□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA BRR6P53062 197 aa1.45□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA CDC123Q05791 360 aa1.45□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA DRS2P39524 1355 aa1.45□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA POP4P38336 279 aa1.44□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA BOL2P53082 120 aa1.44□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA RHO1P06780 209 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP1.44□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA MRPS28P21771 286 aa1.44□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA YBR220CP38318 560 aa1.44□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA URA8P38627 578 aaPredicted RBP1.44□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA YNL217WP40152 326 aa1.44□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA SNZ1Q03148 297 aa1.44□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA MZM1Q03429 123 aaPredicted RBP1.44□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA SPG3Q04398 127 aaPredicted RBP1.44□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA THP2O13539 261 aaKnown RBP1.43□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA PPA2P28239 310 aa1.43□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA MRPL28P36527 147 aa1.43□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA FAR7P43592 221 aa1.43□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA DOC1P53068 250 aa1.43□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA YDR248CQ03786 193 aa1.43□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA YLR162WQ06235 118 aa1.43□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA CYR1P08678 2026 aaKnown RBP1.43□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA CDC28P00546 298 aaKnown RBP1.42□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA YLR156WP0CE96 114 aa1.42□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA YLR159WP0CE97 114 aa1.42□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA YLR161WP0CE98 114 aa1.42□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA YMR31P19955 123 aa1.42□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA FZF1P32805 299 aa1.42□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA BXI1P48558 297 aa1.42□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA CSI2Q08054 341 aa1.42□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA SEY1Q99287 776 aa1.42□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA UBR2Q07963 1872 aa1.42□□□□□ -2.18
15S_rRNA15S_rRNA BMH2P34730 273 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
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