RNA–Protein interactions for RNA: YPL194W

DDC1, Transcript of DNA damage checkpoint protein, yeast

Gene DDC1, Length 1,839 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDC1	YPL194W	XBP1	P40489	647 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDC1	YPL194W	JJJ3	P47138	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDC1	YPL194W	AIM25	P47140	327 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDC1	YPL194W	AVT4	P50944	713 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDC1	YPL194W	APS2	Q00381	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDC1	YPL194W	YET2	Q04210	160 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDC1	YPL194W	FDH1	Q08911	376 aa		4.97	□□□□□ -1.61
DDC1	YPL194W	AIR2	Q12476	344 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
DDC1	YPL194W	REV3	P14284	1504 aa		4.96	□□□□□ -1.61
DDC1	YPL194W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	PHO13	P19881	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YMC1	P32331	307 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	AEP1	P32493	518 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YBR220C	P38318	560 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	SPL2	P38839	148 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	ILM1	P47155	203 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	SLM3	Q12093	417 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	HRT3	Q12347	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	UBI4	P0CG63	381 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	PEX34	P25584	144 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	KAE1	P36132	386 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	SOL1	P50278	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YMR253C	Q04835	414 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YAP7	Q08182	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	GPA2	P10823	449 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YCR100C	P25606	316 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YNL320W	P42840	284 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	BUL1	P48524	976 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	TRM12	Q04235	462 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YLR224W	Q05947	369 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	LIP2	Q06005	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	GEP5	Q12393	293 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	PRM4	Q12498	284 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	MIT1	P40002	666 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YEA4	P40004	342 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	ARG2	P40360	574 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YGL101W	P53144	215 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	NUP100	Q02629	959 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	SHH4	Q06236	168 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	CNL1	Q06333	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	TRM732	Q03496	1420 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	SIN3	P22579	1536 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	PMU1	P36069	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	COS8	P38723	381 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	CHL4	P38907	458 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	PET8	P38921	284 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	ATG22	P25568	528 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	APS1	P35181	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	ARN2	P38724	620 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
DDC1	YPL194W	COF1	Q03048	143 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YML018C	Q03730	393 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	GMC1	Q04399	608 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	IRC10	Q08118	586 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	FRE8	Q12209	686 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	BUD4	P47136	1447 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	ERD2	P18414	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
DDC1	YPL194W	MRP21	P38175	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YBR062C	P38239	180 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	ARN1	P38731	627 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	APQ12	P40532	138 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	ORC5	P50874	479 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	SDT1	P53078	280 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	THI20	Q08224	551 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	TIM18	Q08749	192 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	TFC7	Q12415	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	PHA2	P32452	334 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	SFC1	P33303	322 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	NAT2	P37293	288 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	YMC2	P38087	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	AVT5	P38176	459 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	PEX17	P40155	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DDC1	YPL194W	AYR1	P40471	297 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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