RNA–Protein interactions for RNA: YOR118W

RTC5, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene RTC5, Length 1,704 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC5	YOR118W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	PGU1	P47180	361 aa		4.09	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	YDL183C	P48569	320 aa		4.09	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	PHB2	P50085	310 aa		4.09	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	MCH4	Q08268	501 aa		4.09	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	YOR376W	Q08900	122 aa		4.09	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	FEX1	Q08913	375 aa		4.09	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	HNM1	P19807	563 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	MCM10	P32354	571 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	SNC2	P33328	115 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	FRM2	P37261	193 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
RTC5	YOR118W	DLS1	P40366	167 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	SYS1	P41544	203 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	CUP9	P41817	306 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	TAD2	P47058	250 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	MSY1	P48527	492 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	POP6	P53218	158 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	RSM27	P53305	110 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	AAH1	P53909	347 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	SAM50	P53969	484 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	PRM15	Q03262	622 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	REX3	Q12090	404 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	FSH3	Q99369	266 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	FLO9	P39712	1322 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	URA6	P15700	204 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	HXT2	P23585	541 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	ADH7	P25377	361 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	TIP1	P27654	210 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	AVT7	P40501	490 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	UBP8	P50102	471 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	BSC5	P53755	489 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	RNH201	P53942	307 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	NNT1	Q05874	261 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	EAF3	Q12432	401 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	ERP4	Q12450	207 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	DAL82	P21705	255 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	MDH2	P22133	377 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	MRP20	P32387	263 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	FIG1	P38224	298 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	SHO1	P40073	367 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	REE1	P40893	198 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	YHC3	P47040	408 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	MIX14	Q04341	121 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	SYM1	Q06563	197 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	HOM3	P10869	527 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	MRS4	P23500	304 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	VAM7	P32912	316 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	POP8	P38208	133 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	UMP1	P38293	148 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	PUG1	P40100	303 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	YIL169C	P40442	995 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	CTK2	P46962	323 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	YAP1802	P53309	568 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	MTM1	P53320	366 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	YDR249C	Q03787	373 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	GRC3	Q07845	632 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	AEP3	Q12089	606 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	MCT1	Q12283	360 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	TFC7	Q12415	435 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	PET20	Q99373	253 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	YLL053C	P0CD98	152 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	YBL010C	P32788	280 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	PPZ2	P33329	710 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	FLO10	P36170	1169 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
RTC5	YOR118W	UBC12	P52491	188 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	NIF3	P53081	288 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	ACS1	Q01574	713 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	MRP51	Q02950	344 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	SDC1	Q03323	175 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	ANT1	Q06497	328 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	AKR2	Q12013	749 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	COX5B	P00425	151 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	MSW1	P04803	379 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTC5	YOR118W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		4.04	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 77.3 ms