RNA–Protein interactions for RNA: YOL080C

REX4, Transcript of Putative RNA exonuclease, yeast

Gene REX4, Length 870 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
REX4	YOL080C	ASG7	P46993	209 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	YNL260C	P53846	198 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	IBD2	P53892	351 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	YNL140C	P53910	189 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	ELC1	Q03071	99 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	SNO1	Q03144	224 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	ADD37	Q03233	198 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	MAK3	Q03503	176 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	TRM12	Q04235	462 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	CDD1	Q06549	142 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	IPK1	Q06667	281 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	MRPL35	Q06678	367 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	FCY22	Q12119	530 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	SNF2	P22082	1703 aa		3.56	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	TDH2	P00358	332 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.55	□□□□□ -1.84	not detected
REX4	YOL080C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	DAL2	P25335	343 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	AEP1	P32493	518 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	SPR1	P32603	445 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	SKT5	P34226	696 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	SWD3	P38123	315 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	YHL044W	P38727	235 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	YHR035W	P38769	630 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	DOG2	P38773	246 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	PFS1	P38872	237 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	END3	P39013	349 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	GAT2	P40209	560 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	TIR3	P40552	269 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	MCM22	P47167	239 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	UBC7	Q02159	165 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	NUP49	Q02199	472 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	ABF2	Q02486	183 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	TMA23	Q03525	211 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	YDR391C	Q04170	232 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	RIF2	Q06208	395 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	PAM18	Q07914	168 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	PCC1	Q3E833	88 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	ULS1	Q08562	1619 aa		3.55	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	OCH1	P31755	480 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	SEC17	P32602	292 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	QDR3	P38227	689 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	YBR137W	P38276	179 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	MST28	P39552	234 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	YEA6	P39953	335 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	HEM14	P40012	539 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	YER121W	P40076	114 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	RRG9	P40156	214 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	SAS2	P40963	338 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	YNL320W	P42840	284 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	NCA3	P46955	337 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	YHC3	P47040	408 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	DAN1	P47178	298 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	NUP57	P48837	541 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	YGL235W	P53071	178 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	ROG1	P53118	685 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	FLC3	P53121	802 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	NOP19	P53317	196 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	YIP3	P53633	176 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	OSH6	Q02201	448 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	SPP2	Q02521	185 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	MRPS16	Q02608	121 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	VPS28	Q02767	242 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	YMR130W	Q04223	302 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	CUR1	Q06469	252 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	BSC6	Q08280	497 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	GPM3	Q12326	303 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	NTE1	Q04958	1679 aa		3.54	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	SNF4	P12904	322 aa		3.53	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	GRX2	P17695	143 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	ERD2	P18414	219 aa		3.53	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	RPB5	P20434	215 aa		3.53	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	SAG1	P20840	650 aa		3.53	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	SEC22	P22214	214 aa		3.53	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	YSR3	P23501	404 aa		3.53	□□□□□ -1.84
REX4	YOL080C	LSB5	P25369	354 aa		3.53	□□□□□ -1.84

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