RNA–Protein interactions for RNA: YML035C

AMD1, Transcript of AMP deaminase, yeast

Gene AMD1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
AMD1	YML035C	POP6	P53218	158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	COX5B	P00425	151 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	PCL1	P24867	279 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	YCR061W	P25639	631 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	AFG1	P32317	509 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	MRPS5	P33759	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	PAN3	P36102	679 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	SEN34	P39707	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	SYS1	P41544	203 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	SSN8	P47821	323 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	GPG1	P53130	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	RSM27	P53305	110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	TIM44	Q01852	431 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	THI72	Q08579	599 aa		4.97	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.96	□□□□□ -1.61	not detected
AMD1	YML035C	CHO1	P08456	276 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	BUD8	P41698	603 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	ACS2	P52910	683 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	TYW3	P53177	273 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	YNR048W	P53740	393 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	API2	Q04413	109 aa		4.96	□□□□□ -1.61
AMD1	YML035C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YHL037C	P38733	133 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	SOL3	P38858	249 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	MOB2	P43563	287 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YGL159W	P53110	370 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	CTF19	Q02732	369 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	SRL2	Q12020	392 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		4.96	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	SEC22	P22214	214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	MAK32	P23060	363 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	CNB1	P25296	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	NAB2	P32505	525 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
AMD1	YML035C	YBL010C	P32788	280 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YER084W	P40057	128 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	CIN2	P46670	268 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	GPI14	P47088	403 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	UBP8	P50102	471 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	SKO1	Q02100	647 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	CRR1	Q05790	422 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	RFU1	Q08003	200 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	ERP4	Q12450	207 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	PET18	P25362	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	PPZ2	P33329	710 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	SSO2	P39926	295 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	AVT7	P40501	490 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YJL016W	P47072	561 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	MCM22	P47167	239 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	SNN1	P48232	102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	SIP18	P50263	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	RNH201	P53942	307 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	ACS1	Q01574	713 aa		4.95	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	PDC2	P32896	925 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	BXI1	P48558	297 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	PHB2	P50085	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	UBC12	P52491	188 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YIP5	P53108	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	SPR28	Q04921	423 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YLR108C	Q12259	485 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	RPL35A	P0CX84	120 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	RPL35B	P0CX85	120 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	RPL30	P14120	105 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	REC114	P32841	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	FLO10	P36170	1169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	LAG1	P38703	411 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	COS8	P38723	381 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	AIM46	P38885	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	ATF1	P40353	525 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	AVT4	P50944	713 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	RRT7	Q07829	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	FIT3	Q08907	204 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	AEP3	Q12089	606 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	TRM13	Q12383	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	FSH3	Q99369	266 aa		4.94	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	UMP1	P38293	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	YIR035C	P40579	254 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
AMD1	YML035C	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	ANT1	Q06497	328 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	MRL1	Q06815	381 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	BLM10	P43583	2143 aa		4.93	□□□□□ -1.62
AMD1	YML035C	TOR1	P35169	2470 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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