RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR104W	YKR104W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.18	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	ATP16	Q12165	160 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	RFM1	Q12192	310 aa		4.18	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	TAO3	P40468	2376 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	SPT3	P06844	337 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.17	□□□□□ -1.74	not detected
YKR104W	YKR104W	URA6	P15700	204 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	LDS1	P31379	325 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	YBR062C	P38239	180 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	RCK1	P38622	512 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	CHL4	P38907	458 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	PRM5	P40476	318 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	NBP35	P52920	328 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	CLD1	P53264	445 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	MSO1	P53604	210 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	YLR460C	P54007	376 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	YMR166C	Q03829	368 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	FAR10	Q06001	478 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	HNT3	Q08702	217 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	MMT2	Q08970	484 aa		4.17	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	YKR104W	P0CE69	306 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	MSI1	P13712	422 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	MEI4	P29467	408 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	MRPL39	P36533	70 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	POP7	P38291	140 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	TPC1	P53257	314 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	YNL140C	P53910	189 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	SNO1	Q03144	224 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	SPG4	Q04438	115 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	RIF2	Q06208	395 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	COQ10	Q08058	207 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	YNG1	Q08465	219 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	TPO4	Q12256	659 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.16	□□□□□ -1.74
YKR104W	YKR104W	COX5A	P00424	153 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	LDB16	P25587	256 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	MCM22	P47167	239 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	YNR066C	P53752	436 aa		4.15	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	PHO80	P20052	293 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	DBF2	P22204	572 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	GPX1	P36014	167 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	HMT1	P38074	348 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	SEN34	P39707	275 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	YJR056C	P47115	236 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	OST3	P48439	350 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	MIG2	P53035	382 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	SPC2	Q04969	178 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	SEI1	Q06058	285 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	GGA1	Q06336	557 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	SFM1	Q12314	213 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	FLO1	P32768	1537 aa		4.14	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	GIT1	P25346	518 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	SPL2	P38839	148 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	COG3	P40094	801 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	EGT2	P42835	1041 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	PDR17	P53844	350 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	ADD37	Q03233	198 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	MIM1	Q08176	113 aa		4.13	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	CPR4	P25334	318 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	ATG15	P25641	520 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	SOK1	P40317	901 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	BXI1	P48558	297 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	YGL235W	P53071	178 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	NRK1	P53915	240 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	DXO1	Q06349	442 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	YOR292C	Q08743	309 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	YDR018C	Q12185	396 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	ERV2	Q12284	196 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	MRX4	Q12467	430 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	PET20	Q99373	253 aa		4.12	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	CPT1	P17898	393 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	RPB5	P20434	215 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	MBA1	P38300	278 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	AVT7	P40501	490 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	CPR7	P47103	393 aa		4.11	□□□□□ -1.75
YKR104W	YKR104W	BIR1	P47134	954 aa		4.11	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.5 ms