RNA–Protein interactions for RNA: YJL025W

RRN7, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeast

Gene RRN7, Length 1,545 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRN7	YJL025W	PEP8	P40335	379 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	AVT4	P50944	713 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YGL260W	P53056	76 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	ALG13	P53178	202 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	SNO1	Q03144	224 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	TRM82	Q03774	444 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YMR166C	Q03829	368 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YLR446W	Q06204	433 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	RSA1	Q08932	381 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YLR112W	Q12130	139 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		3.21	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YAL064W-B	O13512	126 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	COX5A	P00424	153 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YBR032W	P38223	100 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	DER1	P38307	211 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YJR056C	P47115	236 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	MCM22	P47167	239 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YPS5	P53057	165 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YGR042W	P53227	271 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	GTR2	P53290	341 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	GOR1	P53839	350 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YLR152C	P54072	576 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YDC1	Q02896	317 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YET2	Q04210	160 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	DPP1	Q05521	289 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	TAZ1	Q06510	381 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	BSC1	Q12140	328 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		3.2	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	HEM4	P06174	275 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
RRN7	YJL025W	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	PMT2	P31382	759 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	PHO89	P38361	574 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
RRN7	YJL025W	WSC4	P38739	605 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	COG3	P40094	801 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	ICE2	P40499	491 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	AGE2	P40529	298 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	UFE1	P41834	346 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	OST3	P48439	350 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	TPN1	P53099	579 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	NRK1	P53915	240 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	NUP49	Q02199	472 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	PIR3	Q03180	325 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YLR281C	Q05863	155 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	PEX30	Q06169	523 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YDL114W	Q07530	308 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	SLD7	Q08457	257 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	HNT3	Q08702	217 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	NSL1	Q12143	216 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	TPO4	Q12256	659 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	EAF3	Q12432	401 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	OCA6	Q12454	224 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	PET20	Q99373	253 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	GPA2	P10823	449 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	CBS2	P14905	389 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
RRN7	YJL025W	PPH21	P23594	369 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	GIT1	P25346	518 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	RIP-Chip
RRN7	YJL025W	YBR096W	P38256	230 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	MAM33	P40513	266 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	TRM9	P49957	279 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	SBH2	P52871	88 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	JAC1	P53193	184 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	SWS2	P53937	143 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	ABF2	Q02486	183 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YML018C	Q03730	393 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	CSN9	Q03981	162 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YPR091C	Q06833	770 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	MMT2	Q08970	484 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	RFM1	Q12192	310 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	FRE8	Q12209	686 aa		3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	MSB2	P32334	1306 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	SPS100	P13130	326 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	AGA1	P32323	725 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	AEP1	P32493	518 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	SGE1	P33335	543 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	MRPL3	P36516	390 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	MRP21	P38175	177 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	ATG12	P38316	186 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YHI9	P38765	294 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	VMA22	P38784	181 aa		3.18	□□□□□ -1.9
RRN7	YJL025W	YIL029C	P40538	142 aa		3.18	□□□□□ -1.9

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