RNA–Protein interactions for RNA: YFL004W

VTC2, Transcript of Subunit of vacuolar transporter chaperone (VTC) complex, yeast

Gene VTC2, Length 2,487 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VTC2	YFL004W	SAM50	P53969	484 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	PET20	Q99373	253 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	Q0144	Q9ZZW2	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	BGL2	P15703	313 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	PRO1	P32264	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	DCG1	P32460	244 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	YKL069W	P36088	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	ICE2	P40499	491 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	IKS1	P47042	667 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	SKP1	P52286	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	BIO5	P53744	561 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	NAT4	Q04751	285 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	ASM4	Q05166	528 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	PAU23	Q07987	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	TPO4	Q12256	659 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	PAU17	Q12370	124 aa		4.91	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	YOL162W	P0CF19	215 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	WSS1	P38838	269 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	YGR066C	P53242	292 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	HNT1	Q04344	158 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	ATG10	Q07879	167 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	SWM1	Q12379	170 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	IZH2	Q12442	317 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	LAS17	Q12446	633 aa		4.9	□□□□□ -1.62
VTC2	YFL004W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	CHO1	P08456	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	PRY2	P36110	329 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YEL073C	P39974	107 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	BUD25	P85052	153 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	ATG39	Q06159	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	OPI10	Q08202	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	MSW1	P04803	379 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	MIH1	P23748	554 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	MSS51	P32335	436 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	UTR5	P32630	166 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	AME1	P38313	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	HSE1	P38753	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	NAS2	P40555	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YJR115W	P47152	169 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YNL143C	P53908	130 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	ROY1	Q04847	553 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	RTN1	Q04947	295 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	RAX2	Q12465	1220 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	ELO2	P25358	347 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YCR100C	P25606	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	FMT1	P32785	401 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YBR220C	P38318	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	MTM1	P53320	366 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	MCH1	Q07376	486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	SLO1	Q3E784	85 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	ODC2	Q99297	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	ERG4	P25340	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	HXT4	P32467	576 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	UPS2	P35200	230 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YEA6	P39953	335 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YEL057C	P39983	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	LOC1	P43586	204 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	ASK10	P48361	1146 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YML018C	Q03730	393 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YML096W	Q04489	525 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	MET32	Q12041	191 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	SAL1	D6W196	494 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	ERS1	P17261	260 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	NFS1	P25374	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	PMU1	P36069	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	CBP4	P37267	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	PEX7	P39108	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YIR016W	P40572	265 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	CDC40	P40968	455 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	ATG27	P46989	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	MIC26	P50087	233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	FLC3	P53121	802 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	YML053C	Q04978	212 aa		4.88	□□□□□ -1.63
VTC2	YFL004W	CTS2	Q06350	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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