RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612199.4

SRGAP2B-204, Transcript of SLIT-ROBO Rho GTPase activating protein 2B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRGAP2B, Length 7,120 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2B-204ENST00000612199 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 TMCC1O94876 653 aa10□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 GFAPP14136 432 aa10□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 RASA1P20936 1047 aa10□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP10□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 DRP2Q13474 957 aa10□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 SNCBQ16143 134 aa10□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF614Q8N883 585 aa10□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 CAPSLQ8WWF8 208 aa10□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
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SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF212Q9UDV6 495 aa10□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 DSEQ9UL01 958 aa10□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa10□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 TECPR2O15040 1411 aa10□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 LRRC14BA6NHZ5 514 aa9.99□□□□□ -0.81
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SRGAP2B-204ENST00000612199 MT-ND3P03897 115 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ST8SIA6P61647 398 aa9.99□□□□□ -0.81
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SRGAP2B-204ENST00000612199 TMED2Q15363 201 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 KIF19Q2TAC6 998 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF667Q5HYK9 610 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ENGASEQ8NFI3 743 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 KLHL29Q96CT2 875 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 CRAMP1Q96RY5 1269 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 CAAP1Q9H8G2 361 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 LCMT1Q9UIC8 334 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 PNMA3Q9UL41 463 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 CACNA1FO60840 1977 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ARHGEF37A1IGU5 675 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 CPP00450 1065 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 STRIP1Q5VSL9 837 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 CEP68Q76N32 757 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF507Q8TCN5 953 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 FAM167AQ96KS9 214 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 C7orf25Q9BPX7 421 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 C11orf70Q9BRQ4 267 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 Q9H521 79 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNF302Q9NR11 478 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 PRPSAP2O60256 369 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ACSL3O95573 720 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 RPN2P04844 631 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 USP11P51784 963 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 CARTPTQ16568 116 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 CEP55Q53EZ4 464 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 OOSP2Q86WS3 158 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 GMCL1Q96IK5 515 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ARL13BQ3SXY8 428 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 TRIM9Q9C026 710 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 NDEL1Q9GZM8 345 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 NDOR1Q9UHB4 597 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 SLC25A13Q9UJS0 675 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 TMED1Q13445 227 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 GTF2H3Q13889 308 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 BBS9Q3SYG4 887 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 TMEM35BQ8NCS4 154 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 TUBB6Q9BUF5 446 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ESYT3A0FGR9 886 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 PDIA5Q14554 519 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 TERF2Q15554 542 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 TRIM67Q6ZTA4 783 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 TMEM39BQ9GZU3 492 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ZNRF3Q9ULT6 936 aa9.99□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 NPY2RP49146 381 aa9.98□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 VAMP7P51809 220 aa9.98□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ARL4CP56559 192 aa9.98□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 IDI2Q9BXS1 227 aa9.98□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 KLC2Q9H0B6 622 aa9.98□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 ADAM21Q9UKJ8 722 aa9.98□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 SNX24Q9Y343 169 aa9.98□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 FDX1P10109 184 aa9.98□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 CPA3P15088 417 aa9.98□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 PSMA2P25787 234 aa9.98□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
SRGAP2B-204ENST00000612199 IFT43Q96FT9 208 aa9.98□□□□□ -0.81
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