RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552189.5

SENP1-210, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SENP1, Length 4,967 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-210ENST00000552189 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
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SENP1-210ENST00000552189 ANKRD40Q6AI12 368 aa8.46□□□□□ -1.06
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SENP1-210ENST00000552189 HELQQ8TDG4 1101 aa8.46□□□□□ -1.06
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SENP1-210ENST00000552189 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.46□□□□□ -1.06
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SENP1-210ENST00000552189 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SENP1-210ENST00000552189 TLE6Q9H808 572 aa8.45□□□□□ -1.06
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SENP1-210ENST00000552189 PPM1AP35813 382 aa8.45□□□□□ -1.06
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SENP1-210ENST00000552189 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
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SENP1-210ENST00000552189 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa8.44□□□□□ -1.06
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SENP1-210ENST00000552189 MCF2P10911 925 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP1-210ENST00000552189 RBL2Q08999 1139 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP1-210ENST00000552189 KRT33BQ14525 404 aa8.44□□□□□ -1.06
SENP1-210ENST00000552189 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
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