RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa21.18■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTPAQ15257 358 aa21.18■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 C1orf186Q6ZWK4 172 aa21.18■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 DAW1Q8N136 415 aa21.18■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.18■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 DEPTORQ8TB45 409 aa21.18■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIFAP3Q92845 792 aa21.18■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 IFT74Q96LB3 600 aa21.18■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRKD2Q9BZL6 878 aa21.18■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 FZD8Q9H461 694 aa21.18■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 RSAD1Q9HA92 442 aa21.18■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP18Q9UMW8 372 aa21.18■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHD8Q9HCK8 2581 aa21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 LILRB5O75023 590 aa21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRRN2O75325 713 aa21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 NPTXRO95502 500 aa21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 ITGA4P13612 1032 aa21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPP2R5AQ15172 486 aa21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM119Q4V9L6 283 aa21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRRC15Q8TF66 581 aa21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC51Q96ER9 411 aa21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHAMP1Q96JM3 812 aa21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 AK8Q96MA6 479 aa21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC113Q9H0I3 377 aa21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 UBN1Q9NPG3 1134 aa21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP21.17■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHD6Q8TD26 2715 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 A0A1B0GUA9 196 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM170BA6NMN3 283 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC169A6NNP5 214 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 SFI1A8K8P3 1242 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 POMCP01189 267 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRKCBP05771 671 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLA2G4BP0C869 781 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 UBA7P41226 1012 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 PEX3P56589 373 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 PFKPQ01813 784 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 DSG1Q02413 1049 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAPK7Q13164 816 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 UBXN2BQ14CS0 331 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC44A4Q53GD3 710 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC27A1Q6PCB7 646 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPR65Q8IYL9 337 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 NELL1Q92832 810 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 NELL2Q99435 816 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 GMEB2Q9UKD1 530 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa21.16■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 NCAM2O15394 837 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 NR1I2O75469 434 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 AKAP5P24588 427 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 LONP1P36776 959 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC12A3P55017 1021 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAPK6Q16659 721 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM187BQ17R55 369 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP49Q70CQ1 688 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 MTSS1LQ765P7 747 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 CNNM3Q8NE01 707 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 CLIC6Q96NY7 704 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP28Q96RU2 1077 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 GAD1Q99259 594 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 MIOSQ9NXC5 875 aa21.15■□□□□ 0.98
CD27-AS1-208ENST00000538616 TGM5O43548 720 aa21.14■□□□□ 0.97
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPATA31D3P0C874 917 aa21.14■□□□□ 0.97
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYBP10242 640 aa21.14■□□□□ 0.97
CD27-AS1-208ENST00000538616 FSHRP23945 695 aa21.14■□□□□ 0.97
CD27-AS1-208ENST00000538616 MLH1P40692 756 aa21.14■□□□□ 0.97
CD27-AS1-208ENST00000538616 OR1G1P47890 313 aa21.14■□□□□ 0.97
CD27-AS1-208ENST00000538616 NPTX2P47972 431 aa21.14■□□□□ 0.97
CD27-AS1-208ENST00000538616 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
CD27-AS1-208ENST00000538616 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa21.14■□□□□ 0.97
CD27-AS1-208ENST00000538616 TAS1R1Q7RTX1 841 aa21.14■□□□□ 0.97
CD27-AS1-208ENST00000538616 PALB2Q86YC2 1186 aa21.14■□□□□ 0.97
CD27-AS1-208ENST00000538616 CALML4Q96GE6 196 aa21.14■□□□□ 0.97
CD27-AS1-208ENST00000538616 EPSTI1Q96J88 318 aa21.14■□□□□ 0.97
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZFP42Q96MM3 310 aa21.14■□□□□ 0.97
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.14■□□□□ 0.97
CD27-AS1-208ENST00000538616 FNIP2Q9P278 1114 aa21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms