RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511587.1

ZBED3-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ZBED3, Length 542 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-203ENST00000511587 KCNG1Q9UIX4 513 aa24.82■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 DOCK8Q8NF50 2099 aa24.82■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 KCNE1P15382 129 aa24.81■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 TCF15Q12870 199 aa24.81■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 TDGQ13569 410 aa24.81■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 MYADMQ96S97 322 aa24.81■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 CNTN3Q9P232 1028 aa24.81■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 MTRRQ9UBK8 725 aa24.81■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 CITO14578 2027 aa24.81■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa24.8■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 TOM1L1O75674 476 aa24.8■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 BMP15O95972 392 aa24.8■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 SMTNP53814 917 aa24.8■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 GRIN1Q05586 938 aa24.8■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 ZPBP2Q6X784 338 aa24.8■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 ACAP3Q96P50 834 aa24.8■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 TCHPQ9BT92 498 aa24.8■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 SLC38A7Q9NVC3 462 aa24.8■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 IGSF9Q9P2J2 1179 aa24.8■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 DUSP12Q9UNI6 340 aa24.8■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 TKTP29401 623 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 PTPN5P54829 565 aa24.79■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 NCKAP1LP55160 1127 aa24.79■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 STRN3Q13033 797 aa24.79■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 RAB33AQ14088 237 aa24.79■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 PIDD1Q9HB75 910 aa24.79■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa24.79■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 ODF2LQ9ULJ1 636 aa24.79■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 HOXA9P31269 272 aa24.78■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 UBA7P41226 1012 aa24.78■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 BRCC3P46736 316 aa24.78■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.78■■□□□ 1.56not detected■□□□□ 8.4
ZBED3-203ENST00000511587 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 REEP2Q9BRK0 252 aa24.78■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa24.78■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 BACE2Q9Y5Z0 518 aa24.78■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 I3L4J1 428 aa24.77■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 PODXLO00592 558 aa24.77■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 TRAPPC3O43617 180 aa24.77■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 C8AP07357 584 aa24.77■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 HARSP12081 509 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 LONP1P36776 959 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 ZNF131P52739 623 aa24.77■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 NUBP1P53384 320 aa24.77■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 MCL1Q07820 350 aa24.77■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 SLC10A6Q3KNW5 377 aa24.77■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 LIN9Q5TKA1 542 aa24.77■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 CALML4Q96GE6 196 aa24.77■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 HAPLN2Q9GZV7 340 aa24.77■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP24.77■■□□□ 1.56
ZBED3-203ENST00000511587 POU2F2P09086 479 aa24.76■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 OR1D2P34982 312 aa24.76■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 MRE11P49959 708 aa24.76■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 SEZ6Q53EL9 994 aa24.76■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 ANKS3Q6ZW76 656 aa24.76■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 GPBP1Q86WP2 473 aa24.76■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 TMEM105Q8N8V8 129 aa24.76■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 RSAD2Q8WXG1 361 aa24.76■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 CDY1Q9Y6F8 540 aa24.76■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 PIEZO1Q92508 2521 aa24.76■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 DOCK6Q96HP0 2047 aa24.75■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 H0YCG3 227 aa24.75■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 LAMP2P13473 410 aa24.75■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 PLCG1P19174 1290 aa24.75■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 RPL9P32969 192 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 PPM1LQ5SGD2 360 aa24.75■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 HAUS6Q7Z4H7 955 aa24.75■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 PHOX2BQ99453 314 aa24.75■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 ANHXE9PGG2 379 aa24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 CLDN3O15551 220 aa24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 NARSO43776 548 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 PTPAQ15257 358 aa24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 UVSSAQ2YD98 709 aa24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 SLC8B1Q6J4K2 584 aa24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 SLC7A14Q8TBB6 771 aa24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 RAD54LQ92698 747 aa24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 NXPE3Q969Y0 559 aa24.74■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 SYN3O14994 580 aa24.73■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 TBC1D4O60343 1298 aa24.73■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 PIGRP01833 764 aa24.73■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 NPR3P17342 541 aa24.73■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 SCP2P22307 547 aa24.73■■□□□ 1.55
ZBED3-203ENST00000511587 FSHRP23945 695 aa24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms