RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4A-208ENST00000489247 A0A0G2JMZ2 1700 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 TTC26A0AVF1 554 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 MEGF11A6BM72 1044 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 DYNC1I1O14576 645 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 ENC1O14682 589 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 DDNO94850 711 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 CYP11A1P05108 521 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 IDEP14735 1019 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 EDNRBP24530 442 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 CCND2P30279 289 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 CASP14P31944 242 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 COPB2P35606 906 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 JAK3P52333 1124 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 HMGCS2P54868 508 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 ADKP55263 362 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 ZBED6P86452 979 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 MAPK7Q13164 816 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 PPIL2Q13356 520 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 MTMR1Q13613 665 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 PTPN14Q15678 1187 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 CYP26C1Q6V0L0 522 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 SLC30A10Q6XR72 485 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 RIOX2Q8IUF8 465 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 C12orf56Q8IXR9 622 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 DAW1Q8N136 415 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 DNERQ8NFT8 737 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 OR8K1Q8NGG5 319 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 BORCS6Q96GS4 357 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 WNK4Q96J92 1243 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 CDHR1Q96JP9 859 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 TAAR1Q96RJ0 339 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 IWS1Q96ST2 819 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 RMDN3Q96TC7 470 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 CORO1BQ9BR76 489 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 LXNQ9BS40 222 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 NDST4Q9H3R1 872 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 ACAD9Q9H845 621 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 DMAC2Q9NW81 257 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 CYP39A1Q9NYL5 469 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 RNF181Q9P0P0 153 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 FBXO40Q9UH90 709 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 RIPK3Q9Y572 518 aa6.09□□□□□ -1.43
ATG4A-208ENST00000489247 RLFQ13129 1914 aa6.09□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6.09□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 ATAD5Q96QE3 1844 aa6.09□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 ASTN1O14525 1302 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 WDR64B1ANS9 1081 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 B4DLN1 442 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 CETN3O15182 167 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 TBCAO75347 108 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 TIAF1O95411 115 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 LCA5LO95447 670 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 KRT18P05783 430 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 CCDC175P0C221 793 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 KCNA2P16389 499 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 SCP2P22307 547 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 KRT9P35527 623 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 QARSP47897 775 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 RARRES1P49788 294 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 ERVK-24P63145 666 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 ENPEPQ07075 957 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 MOGSQ13724 837 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 LRRC41Q15345 812 aa6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
ATG4A-208ENST00000489247 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms