RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 BRCC3P46736 316 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 ZPBP2Q6X784 338 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 PLCD3Q8N3E9 789 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 ASIC4Q96FT7 647 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 MTMR6Q9Y217 621 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 PLXNA3P51805 1871 aa20.55■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 CLDN3O15551 220 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 FAM13AO94988 1023 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 KCNE1P15382 129 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 FGFR3P22607 806 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.54■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 MTMR3Q13615 1198 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 SLC10A6Q3KNW5 377 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 OTOP3Q7RTS5 596 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 BICD1Q96G01 975 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 CLIC6Q96NY7 704 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 PARVGQ9HBI0 331 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 CNTN3Q9P232 1028 aa20.54■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 H0YCG3 227 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 PODXLO00592 558 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 TKTP29401 623 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 DDIT3P35638 169 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 ZNF131P52739 623 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 MCL1Q07820 350 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 PIDD1Q9HB75 910 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 TBX20Q9UMR3 447 aa20.53■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 K7ENM7 598 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 TRAPPC3O43617 180 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 TRAK2O60296 914 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 ZMYND10O75800 440 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 OR1D2P34982 312 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 PDXDC1Q6P996 788 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 CYP26C1Q6V0L0 522 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 USP28Q96RU2 1077 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 PRKD2Q9BZL6 878 aa20.52■□□□□ 0.88
UPP1-211ENST00000482015 CLUHO75153 1309 aa20.52■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 STX6O43752 255 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 PAPLNO95428 1278 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 CXCL8P10145 99 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 LIG4P49917 911 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 SPAG1Q07617 926 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 UBALD2Q8IYN6 164 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 FBXL6Q8N531 539 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 KCNN1Q92952 543 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 FIZ1Q96SL8 496 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 MTRRQ9UBK8 725 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.51■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 RPL9P32969 192 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 TNFSF9P41273 254 aa20.5■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 RAB33AQ14088 237 aa20.5■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 DYMQ7RTS9 669 aa20.5■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 STAMQ92783 540 aa20.5■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 KCNK12Q9HB15 430 aa20.5■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa20.5■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.5■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 DENND4AQ7Z401 1863 aa20.5■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 C2orf16Q68DN1 1984 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 C8AP07357 584 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 CLTAP09496 248 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 SLC39A14Q15043 492 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 PPM1LQ5SGD2 360 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 IER5LQ5T953 404 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 LIN9Q5TKA1 542 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 MYADMQ96S97 322 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.49■□□□□ 0.87
UPP1-211ENST00000482015 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms