RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481348.5

ABCD4-210, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 5

Gene ABCD4, Length 1,177 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-210ENST00000481348 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 CITO14578 2027 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 CLUHO75153 1309 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 VWA8A3KMH1 1905 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 CLDN3O15551 220 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 ZMYND10O75800 440 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 KCNE1P15382 129 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 FGFR3P22607 806 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 NCKAP1LP55160 1127 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 LIN9Q5TKA1 542 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 GPBP1Q86WP2 473 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 PRRX2Q99811 253 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 REEP2Q9BRK0 252 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 CNTN3Q9P232 1028 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-210ENST00000481348 FAM13AO94988 1023 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 PLCG1P19174 1290 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 AVPR2P30518 371 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 GRIN1Q05586 938 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 MCL1Q07820 350 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 TDGQ13569 410 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 RAB33AQ14088 237 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 IER5LQ5T953 404 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 MYCT1Q8N699 235 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 C3orf58Q8NDZ4 430 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 KCNN1Q92952 543 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 BICD1Q96G01 975 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 KCNK12Q9HB15 430 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 MTRRQ9UBK8 725 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 FBXW11Q9UKB1 542 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 CLIC4Q9Y696 253 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 PODXLO00592 558 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 ADAM12O43184 909 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 KRT18P05783 430 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 C8AP07357 584 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 SYT1P21579 422 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 SCP2P22307 547 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 TKTP29401 623 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 RPL9P32969 192 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 OR1D2P34982 312 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 BRCC3P46736 316 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 VCPP55072 806 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 MCM6Q14566 821 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 SEZ6Q53EL9 994 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 PPM1LQ5SGD2 360 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 LRRC15Q8TF66 581 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 RAD54LQ92698 747 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 MYADMQ96S97 322 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 ZHX3Q9H4I2 956 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 PARVGQ9HBI0 331 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 BACE2Q9Y5Z0 518 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 ZNF318Q5VUA4 2279 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 I3L4J1 428 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 TRAK2O60296 914 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 HOXA9P31269 272 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 DDIT3P35638 169 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 LIG4P49917 911 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 ZNF131P52739 623 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 NHLH1Q02575 133 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 PTPAQ15257 358 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 KYAT1Q16773 422 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 UVSSAQ2YD98 709 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 RTL10Q7L3V2 364 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 NXPE3Q969Y0 559 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 EPS15L1Q9UBC2 864 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 CCDC39Q9UFE4 941 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 TBX20Q9UMR3 447 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 DUSP12Q9UNI6 340 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-210ENST00000481348 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms