RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465158.5

RBM39-225, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 825 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-225	ENST00000465158	MYB	P10242	640 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	CYP2C9	P11712	490 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	COL8A1	P27658	744 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	HOXC8	P31273	242 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	ACLY	P53396	1101 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	PTEN	P60484	403 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	IGBP1	P78318	339 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	HTRA3	P83110	453 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	LRRC41	Q15345	812 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	TRIM50	Q86XT4	487 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	RNF149	Q8NC42	400 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	EDARADD	Q8WWZ3	215 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	KAT2B	Q92831	832 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	TMEM143	Q96AN5	459 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	CCDC51	Q96ER9	411 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	CNOT6L	Q96LI5	555 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	FAM81B	Q96LP2	452 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	UCN2	Q96RP3	112 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	TUBGCP2	Q9BSJ2	902 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	UTP18	Q9Y5J1	556 aa	Known RBP eCLIP	7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	GTPBP10	A4D1E9	387 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	TMEM150B	A6NC51	233 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	ZNF233	A6NK53	670 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	PMM2	O15305	246 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	ADCY6	O43306	1168 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	PGK1	P00558	417 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	PRKCB	P05771	671 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	THBS1	P07996	1170 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	SRGAP2C	P0DJJ0	459 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	GTF2H1	P32780	548 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	ZNF75D	P51815	510 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	ADAM17	P78536	824 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	BEX3	Q00994	111 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	PTK7	Q13308	1070 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	ITGA7	Q13683	1181 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	CAPS	Q13938	189 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	NR1I3	Q14994	352 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	MTFR1	Q15390	333 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	CD302	Q8IX05	232 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	HACE1	Q8IYU2	909 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	GPD1L	Q8N335	351 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	HPS3	Q969F9	1004 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	TCHP	Q9BT92	498 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	RNF208	Q9H0X6	261 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	NDST4	Q9H3R1	872 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	FZD8	Q9H461	694 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	GPAM	Q9HCL2	828 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	CHST12	Q9NRB3	414 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	SETD4	Q9NVD3	440 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	DMAC2	Q9NW81	257 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	IFNK	Q9P0W0	207 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		7.27	□□□□□ -1.24
RBM39-225	ENST00000465158	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-225	ENST00000465158	LGALS16	A8MUM7	142 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-225	ENST00000465158	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-225	ENST00000465158	CDK2AP1	O14519	115 aa		7.27	□□□□□ -1.25

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