RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462123.5

SIKE1-204, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIKE1, Length 394 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-204ENST00000462123 SEL1LQ9UBV2 794 aa22.79■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.79■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 C2CD4DB7Z1M9 353 aa22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 OSTNP61366 133 aa22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 SIGLEC14Q08ET2 396 aa22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 PSMD5Q16401 504 aa22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 SLC10A6Q3KNW5 377 aa22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 ANKS3Q6ZW76 656 aa22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 KREMEN2Q8NCW0 462 aa22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 STAMQ92783 540 aa22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 B3GALT6Q96L58 329 aa22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 USP28Q96RU2 1077 aa22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 FIZ1Q96SL8 496 aa22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 CLSTN3Q9BQT9 956 aa22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 CDH22Q9UJ99 828 aa22.78■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 HOXA9P31269 272 aa22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 LIG4P49917 911 aa22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 RAB33AQ14088 237 aa22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 UVSSAQ2YD98 709 aa22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 KANK3Q6NY19 840 aa22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 USP49Q70CQ1 688 aa22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 CEP57Q86XR8 500 aa22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 PALB2Q86YC2 1186 aa22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 HSCBQ8IWL3 235 aa22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 HASPINQ8TF76 798 aa22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 BICD1Q96G01 975 aa22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 MTRRQ9UBK8 725 aa22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 SORCS3Q9UPU3 1222 aa22.77■■□□□ 1.24
SIKE1-204ENST00000462123 K7ENM7 598 aa22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 SYN3O14994 580 aa22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 PPP6R2O75170 966 aa22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 ZMYND10O75800 440 aa22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 ADRB2P07550 413 aa22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 POU2F2P09086 479 aa22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 WEE2P0C1S8 567 aa22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 CYP3A5P20815 502 aa22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 SV2BQ7L1I2 683 aa22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 CD302Q8IX05 232 aa22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 HVCN1Q96D96 273 aa22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 PRKD2Q9BZL6 878 aa22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 FBXW11Q9UKB1 542 aa22.76■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 A0A0B4J269 797 aa22.75■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 TTC26A0AVF1 554 aa22.75■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 TMEM221A6NGB7 291 aa22.75■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 M0R296 226 aa22.75■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 PODXLO00592 558 aa22.75■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 OGTO15294 1046 aa22.75■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 GAP43P17677 238 aa22.75■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 PAX3P23760 479 aa22.75■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 MTMR3Q13615 1198 aa22.75■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 SPECC1Q5M775 1068 aa22.75■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.75■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 CLIC6Q96NY7 704 aa22.75■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 HARSP12081 509 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 ZBTB6Q15916 424 aa22.74■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 ATL3Q6DD88 541 aa22.74■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 SLFN12LQ6IEE8 588 aa22.74■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 HFE2Q6ZVN8 426 aa22.74■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 ZNF720Q7Z2F6 126 aa22.74■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.74■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 DDX12PQ92771 950 aa22.74■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 NXPE3Q969Y0 559 aa22.74■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.74■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.74■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.74■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 STYXL1Q9Y6J8 313 aa22.74■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 C5orf42Q9H799 3197 aa22.73■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 FAM189A1O60320 539 aa22.73■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 RFPL2O75678 378 aa22.73■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 YEATS4O95619 227 aa22.73■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 LRPAP1P30533 357 aa22.73■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 STK38Q15208 465 aa22.73■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 LIN9Q5TKA1 542 aa22.73■■□□□ 1.23
SIKE1-204ENST00000462123 SLC8B1Q6J4K2 584 aa22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms