RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R2P41236 205 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PHKA1P46020 1223 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPK7Q13164 816 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 RASGRF1Q13972 1273 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SEC23AQ15436 765 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SBK1Q52WX2 424 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 RFX8Q6ZV50 586 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 GLIS3Q8NEA6 775 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 NAT14Q8WUY8 206 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 IER2Q9BTL4 223 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CCSER1Q9C0I3 900 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 USP40Q9NVE5 1235 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 NAGPAQ9UK23 515 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 AMFRQ9UKV5 643 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 COL4A5P29400 1685 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 BTNL10A8MVZ5 291 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 EYA4O95677 639 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 VIL1P09327 827 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPN4P29074 926 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 GSTA3Q16772 222 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CFAP157Q5JU67 520 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 AADACL2Q6P093 401 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CCDC174Q6PII3 467 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CATIPQ7Z7H3 387 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 GPC2Q8N158 579 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 STKLD1Q8NE28 680 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR60Q8WVS4 1066 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 STMN2Q93045 179 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 GRAMD1AQ96CP6 724 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MIS12Q9H081 205 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CLIC5Q9NZA1 410 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 RASAL2Q9UJF2 1139 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 IQCA1LA6NCM1 817 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM187AA6NFU0 413 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MAGEB3O15480 346 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6B1O95007 311 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ATG7O95352 703 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 C7P10643 843 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 NOVP48745 357 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 HPCAP84074 193 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PTK7Q13308 1070 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP2R5CQ13362 524 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ZCWPW2Q504Y3 356 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP4X1Q8N118 509 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SPIRE2Q8WWL2 714 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC35B4Q969S0 331 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 HAUS1Q96CS2 278 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC39A13Q96H72 371 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 HES6Q96HZ4 224 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 OPHN1O60890 802 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 DCTN3O75935 186 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ACTN1P12814 892 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SCG2P13521 617 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 RARGP13631 454 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TNNI2P48788 182 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 GPSM2P81274 684 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 STRN3Q13033 797 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 IZUMO2Q6UXV1 221 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SLFN11Q7Z7L1 901 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 LZICQ8WZA0 190 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 MRIQ9BWK5 157 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 KMT5AQ9NQR1 393 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CIDEBQ9UHD4 219 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 PHTF1Q9UMS5 762 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 LZTS1Q9Y250 596 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 USTQ9Y2C2 406 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 FLT1P17948 1338 aa8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 TRAF5O00463 557 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 FOSP01100 380 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-203ENST00000439720 CHRNA5P30532 468 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.9 ms