RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423296.6

WDR48-204, Transcript of WD repeat domain 48, humanhuman

TSL 4

Gene WDR48, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48-204ENST00000423296 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa7.13□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 CEP170P1Q96L14 293 aa7.13□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 NOX5Q96PH1 765 aa7.13□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa7.13□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa7.13□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.13□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 TXNRD2Q9NNW7 524 aa7.13□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.13□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 FBXL5Q9UKA1 691 aa7.13□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 V9GYY5 206 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 LCTP09848 1927 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 MACROD2A1Z1Q3 448 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 ZBTB39O15060 712 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 EPHB6O15197 1021 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 MAPK13O15264 365 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 TGFB1I1O43294 461 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 PEX10O60683 326 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 ERLIN1O75477 346 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 LCA5LO95447 670 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 UCHL3P15374 230 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 KCNA2P16389 499 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 ITGB7P26010 798 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 HOXD13P35453 343 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 RGS2P41220 211 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 STAT1P42224 750 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 FMO5P49326 533 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 NCKAP1LP55160 1127 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 PEX3P56589 373 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 ACTR2P61160 394 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 PRKCEQ02156 737 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 SP4Q02446 784 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 ARID5AQ03989 594 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 STRN3Q13033 797 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 MAPK7Q13164 816 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 NEDD9Q14511 834 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 XKR3Q5GH77 459 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 KCNV1Q6PIU1 500 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 LBX2Q6XYB7 198 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 HAUS6Q7Z4H7 955 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 C12orf56Q8IXR9 622 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 EXOC8Q8IYI6 725 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 FAM133AQ8N9E0 248 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 XXYLT1Q8NBI6 393 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 SLC35C1Q96A29 364 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 BICD1Q96G01 975 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 PORCNQ9H237 461 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 GANQ9H2C0 597 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 POLD4Q9HCU8 107 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 KMT5AQ9NQR1 393 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 AIPL1Q9NZN9 384 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 SAR1BQ9Y6B6 198 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa7.12□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 SLC16A4O15374 487 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 P4HA2O15460 535 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 PJA2O43164 708 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 GPR37L1O60883 481 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 ATP9AO75110 1047 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 GFPT2O94808 682 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 NOL4O94818 638 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 CCNE2O96020 404 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 PON1P27169 355 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 ICAM3P32942 547 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 CASP4P49662 377 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 VAMP7P51809 220 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 RTP1P59025 263 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 GTF2BQ00403 316 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 CYP27A1Q02318 531 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 KCNA1Q09470 495 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 BFSP1Q12934 665 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 KCTD2Q14681 263 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 SLC18A3Q16572 532 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 UGCGQ16739 394 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 CCDC181Q5TID7 509 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 PLA2G4FQ68DD2 849 aa7.11□□□□□ -1.27
WDR48-204ENST00000423296 SWSAP1Q6NVH7 229 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms