RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 MTMR12Q9C0I1 747 aa23.93■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 KLK14Q9P0G3 267 aa23.93■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 TRIM43BA6NCK2 446 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 TIMP1P01033 207 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 TNNC2P02585 160 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 NFICP08651 508 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 TRIM14Q14142 442 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 DEFB128Q7Z7B8 93 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 NT5DC4Q86YG4 428 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 CPLX3Q8WVH0 158 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 C2CD2Q9Y426 696 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 PHACTR2O75167 634 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 GYPCP04921 128 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 TPM1P09493 284 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 ACTN1P12814 892 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 TMEM132DQ14C87 1099 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 FIGNQ5HY92 759 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 TRIM65Q6PJ69 517 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 CCDC186Q7Z3E2 898 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 LMO3Q8TAP4 145 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 KIF12Q96FN5 646 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 CXCL16Q9H2A7 254 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 PLCB1Q9NQ66 1216 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 RAB20Q9NX57 234 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 CNTN3Q9P232 1028 aa23.92■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 MICAL3Q7RTP6 2002 aa23.91■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 C9IYK1 514 aa23.91■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 RAG1P15918 1043 aa23.91■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 RNF169Q8NCN4 708 aa23.91■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 LINC01599Q8WXQ3 324 aa23.91■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 LPPQ93052 612 aa23.91■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 PGBD4Q96DM1 585 aa23.91■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 IQCDQ96DY2 449 aa23.91■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 C1orf112Q9NSG2 853 aa23.91■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 GIT1Q9Y2X7 761 aa23.91■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 DERAQ9Y315 318 aa23.91■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 MEIS3P2A8K0S8 358 aa23.9■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 EPHB6O15197 1021 aa23.9■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 CASP14P31944 242 aa23.9■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 RFC2P35250 354 aa23.9■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 APBA1Q02410 837 aa23.9■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 XKR4Q5GH76 650 aa23.9■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa23.9■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.9■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 SEMA4DQ92854 862 aa23.9■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 TTYH3Q9C0H2 523 aa23.9■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 TTC3P53804 2025 aa23.9■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 ENPP3O14638 875 aa23.89■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 LRRN2O75325 713 aa23.89■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 NOL4O94818 638 aa23.89■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 VNN1O95497 513 aa23.89■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 HLA-DRAP01903 254 aa23.89■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 ITGB8P26012 769 aa23.89■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 PIK3CAP42336 1068 aa23.89■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 GSDMDP57764 484 aa23.89■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa23.89■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 AGMOQ6ZNB7 445 aa23.89■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 TSPAN18Q96SJ8 248 aa23.89■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 RNF19AQ9NV58 838 aa23.89■■□□□ 1.42
CTU2-201ENST00000312060 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa23.89■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 CST3P01034 146 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 FAM189BP81408 668 aa23.89■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 GLRA4Q5JXX5 417 aa23.89■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 GANQ9H2C0 597 aa23.89■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 SIX2Q9NPC8 291 aa23.89■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 UBN1Q9NPG3 1134 aa23.89■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 CAPN11Q9UMQ6 739 aa23.89■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 EOMESO95936 686 aa23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 KCNE1P15382 129 aa23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 ADKP55263 362 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 GOLGA8FQ08AF8 430 aa23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 LRMPQ12912 555 aa23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 NCOA4Q13772 614 aa23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 ZBTB6Q15916 424 aa23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 TCTN1Q2MV58 587 aa23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 ABHD8Q96I13 439 aa23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 GAD1Q99259 594 aa23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 EDEM3Q9BZQ6 932 aa23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 RSAD1Q9HA92 442 aa23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 CEP72Q9P209 647 aa23.88■■□□□ 1.41
CTU2-201ENST00000312060 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms